实验
报告
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实验课程: 生物信息学
学 号:
姓 名:
专业班级:
指导老师:
实验四 蛋白质结构与功能预测
[实验目的]
掌握蛋白质一级、二级和三级结构
分析
定性数据统计分析pdf销售业绩分析模板建筑结构震害分析销售进度分析表京东商城竞争战略分析
的一些工具,了解与蛋白质功能分析相关的数据库,如:SwissProt蛋白质序列数据库、PDB结构数据库等。
[实验原理]
现有的蛋白质功能分析工具和平台都是根据已知的蛋白质结构进行诠释分析、
总结
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结构规律建立参考数据库,并以此作为预测未知蛋白质结构和功能的依据。
[实验
内容
财务内部控制制度的内容财务内部控制制度的内容人员招聘与配置的内容项目成本控制的内容消防安全演练内容
]
1、 熟悉与蛋白质分析相关的数据库资源,如SwissProt蛋白质序列数据库、PDB结构数据库、PROSITE
2、 利用PredictProtein对蛋白质序列进行分析
3、 利用swiss-model对蛋白质序列进行三维结构预测
[实验步骤]
1、首先我们选取几段蛋白质序列
序列的格式为FASTA格式,FASTA是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来编码,且允许在序列前添加序列名及注释,如下图所示。
然后我们将准备好的氨基酸序列复制到
点击predictprotein等待几分钟即可得到相应的结果
下图为蛋白质的二级结构预测图
下图是关于这个蛋白质的基础组成和基本的蛋白质概述
然后我们将氨基酸序列复制到
点击build model即可得到三维结构
三维结构为