中国大陆EV71病毒分离株的分子流行病学研究

中国大陆EV71病毒分离株的分子流行病学研究 硕博专栏论著?? 病毒分离株的分子流行病学研究中国大陆 EV71 1，21，21，21，22，31，2江 丽 凤 叶 鹏 凌 高 风 华 冯 谦 谨 郭 中 敏 陆 家 海 ，，，，， 中山大学公共卫生学院广东 广州 热带病防治研究教育部重点实验室广东省重大传染病预防和控制 ,1,，510080,2,， 技术研究中心广东 广州 中山大学实验动物中心广东 广州 ，510080,3,，510080, 摘 要 年中国大陆肠道病毒 型 目 的 了 解 分离株的分子流行病学特点及其种 系 进 化 基 因 分 , 1987)2010 71 ,EV71, 、 型和遗传变异性上获得中国大陆来源的具有完整 或近似完整 基因的核苷酸序列 方法 从 。 GenBank, N CBI VP1 VP1 信息的 株 毒株进行分析采 用 软 件 构建系统进化树 计算相同或不同基因型及基因 亚 型毒株 413 EV71 ，MEGA 5,0 ， ， 的核苷酸与氨基酸的相似性年中国大陆 个省市或地区均分离到具有完整 序列的毒株结果 。 1987)2010 ，20 、VP1 ， 且 年以来数量陡增 中国大陆流行的主要是 型 年 安 徽 和 年 湖 北 发 现 了 型 只 有 各 基 因 型 在2008 ,C ， 2008 2009 A , 等氨基酸位点发生了特异性变异 从健康人体内分离的 毒 株 与43、58、142、164、167、184、240、249、292 , HQ129932 其 他 序 列 比 较 结 论型株可能具有更强的传染力氨基酸位点变异对于 病毒进化有 氨 基酸无特异性变异 ， 。 C ,EV71 重要意义基因与疾病的严重程度无明显关联亚型疫苗候选疫苗株对其他基 因型毒株的交叉保护 应加强 ,VP1 , C4a 作用研究。 关键词病毒分离株氨基酸基因 ,EV71 ,,VP1 中 图 分 类 号 文 献 标 识 码 文章编号 ,R373,2,A, 1672361-9,2011,12-134105- Molecular epidemiology and evolution of enterovirus 71 strains isolated from mainland China ，，，，，，121212122312JIANG Li-feng，YE Peng-ling，GAO Feng-hua， FENG Qian-jin， GUOZh ong-min， LU Jia-hai ,1,School of PublicHealt h， SunY at-sen Universit，yGuangdong，Guangzhou 510080,2,Key Laboratory of TropicalDisease Control, Sun Yat-sen Universit,yMinist，ry of Educatio，nGuangdong Provincial Research Center for SevereInfectiou s Disease Prevention and Control Tech，nologGuangdonyg，Guangzhou 510080,3,Experiment AnimalCente ，rSun Yat-sen Universit，y Guangdong，Guangzhou 510080，China, Abstract,Objective To understand theole cmular epidemiology and evolution of E V71 isolated from 1987 to 2010 in mainland China, Methods The 413nu cleotide sequences EoVf71 originated from China with complete sequenrtciael or pasequence VoP1f were obtained from GenBa,nk N CBI and used for the logphenyetic trees construction using MEGA 5,0 software, The similarity of nucleotide anda mino acid weree stimated between groups and wgitrohupin s, Results Since198 7， The strains with compleVteP1 sequence had beeisolna ted from 20pr ovinces ，c ities or regions in mainland China andsh owed a rapid growth trend a200fte8r, C-type was populainr the past more than twyeenartsy ，a ndA -type was only foundin 2008 o f Anhui andin 2009 oHf ubei, Each genotype hspaedc ific variation between numb43er ，5 8， 142， 164， 167， 184， 240， 249， and 292am ino acid residues, Compared to oth4e-rt yCpe strain ，s amples froma lhthye children had nosp ecific variation in the amino acid, Conclusions C-type strain may be moirenf ectious and thev ariation of the maino acids may play aimn portant role in the evolution of EV71, It was nosi gnificant association betweenV P1 gene and thesev erity of thed isease, It must strengthen the study ocfr othess-pr otection effect among C4a subvtayccpeine candidate and other genosttryapine,s Key words,the isolated EV71 strains, amino acid,VP1 gene 肠 道 病 毒 型 脚和口腔粘膜疱疹或溃疡为主要的 感 染 主要引起儿童手,， , 、71 enterovirus 71EV71 临床特征的手足口病,hand-foot-and-mouth diseas，e 严重者可引起无菌性脑膜炎 脊 髓 灰 质 炎 , ，、 HFMD基金项目 广州市卫生局医药卫生科技重大项 目 , ,201102A21100,3,,1,样瘫痪致命性脑炎等中枢神经系统并发症、。 1969 广东省科技 计划 项目进度计划表范例计划下载计划下载计划下载课程教学计划下载 项目 中 山 大 学 实 验 ,2010B03160007,6 , 年病毒首次从美国加利福尼亚州的婴儿粪便 室开放基金项目，EV71 ,KF201046, ,,2作 者 简 介 江 丽 凤 硕 士 在 读 研 究 方向为分子流行病学与 , ,1986) , ，， 标本中分离出来 现已在全世界引起多次 高 死 亡 ， ,3,疫苗学 率的流行暴发年中国大陆 病例已 。 2010 ，HFMD 通讯作者陆家海 博士 教授 研究方向为分子流行病学与疫苗学 ,， ， ， ， ,4,达 例例其主要病原体为 死亡 1 774 669 ， 905 ，EV71 郭中敏 博士 副教 授 研 究 E-mail,jiahailu,yahoo,com,cn , ， ， ， 病毒和柯萨奇病毒 组 型 A 16 ,coxsackievirus A16， 方向为胚胎干细胞药理学实验动物学、、，E-mail,zhongminguo 可引起严重并发症导致社会的恐CoxA16, 。 EV71 ， ,yaho,ocom,cn 慌因此有必要借助分子流行病学和基因分析的方重复取样数目来分析进化树， 。法对 进行监测EV71 。 用 成 对 比 较 核 苷 酸 和 氨 基 酸 序 列 分 析 1,3，根据肠道病毒 部分基因或 5’NTR、VP1 VP4 法计算毒株间的遗传 Maximum ComposLitikee lihood ,,5)8编 码基因进行分子流行病学分析的报道不少， 组内和组间比较法计算相同或不同基因型及距离，但研 究 编码基因的比较多以往关于 基VP1 ，VP1 基因亚型的相似性用核苷酸序列相似百分比表示，，因的分 ,,10其最大值和最小值用以预测相似性的区间。 子流行病学研究只针对部分地区或年份开展尚未， 见对中国历年所有的流行毒株进行全面的分析本。 结 果 2研究在 中收集含 区完整或近乎 GenBank, N CBI VP1 完整的核苷酸序列信息的 株 毒株进行分 413 EV71 获 得 的 的 核 苷 酸 序 列 信 息 株病毒 2,1 EV71 413 析并进行系统进化树的构建相似性分析以及氨基 ，、 株均分离于 年株 其中广东省 表1987)2010 ， 97 , 酸位点突变分析。 登录号缺乏 端的 个1, 。GU19018,1GenBank ,59 ’ 核 苷 酸 缺 乏端 的个 核 苷 酸 ，3，HM7760253 材料与方法 1 ’缺 乏 个 核 苷 端 的 、 ’EU697901EU697902 37 酸 ， 的 核 苷 酸 序 列 的 获 得从 1,1 EV71 GenBank, 缺乏 端的 个核苷酸缺AY895091 39 ，GQ891758 ’官方网站搜索 获得中国大陆的 毒 株 的 NCBI EV71 乏 核苷酸序列信息截止至 年 月 日获得中 ，2011 5 6 ，端的 个核苷酸其余均具有完整的 序315 ，VP1 ’国大陆全部具有完整 基因碱基数或 VP1 ,?891 bp,列这些信息的缺失并不影响系统进化树的构建。 ， 近似完整 基因 序 碱基数的 VP1 , ?876 bp, EV71 因此 将这几株病毒的核苷酸序列并入分析 。 其余均从患者的株从正常儿童的粪便标本中获得，列共 株表 ，413 ,1, 。HQ129932 临床样本中获得。 对 条 序 列 对 位 排 列 及 构 建 系 统 进 化 采 用 序 列 对 位 排 列 及 系 统 进 化 树 构 1,22,2413 树 建 中的 法对获得的所有毒株 与 碱基 序列进行比对后发现，MEGA 5,0 Clustal W VP1AB115490 AB115491 ,,9的核苷酸序列及参比序列进行多序列比对 同 时 序 列 完 全 相 同 与 只 有 第 ， ，AB115492 AB115493 99 手工检查移位删除不合格及重复序列邻近归并法 位 碱 基 不 同 和 分 别 在 核 苷 ，,,HM038013 HM037806 和 模 型 构 建 系 统 进 酸位点 处出现移位现象会造成 Maximum ComposLitikee lihood 715)737、427)468 ， 氨基酸翻译的不准确系统进化分析时删去这 条，2 。 化树用 引导检测次的程序进行 ，Bootstrap, , 1 000 表 中国大陆不同年份获得的 病毒分离株情况 1 EV71 Tab,1 The EV71 virusiso lated in different years from mainChlandina 地点合计 ,,,19871997199820002001200220032004200520062007200820092010 广东 0010324110005197,23,5,250山东 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 56 8 20 0 88,21,3, 安徽 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 53 1 55,13,3, 0 江苏 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 29 31,7,5, 0 北京 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 22 5 30,7,3, 0 上海 0 0 0 4 0 2 0 0 0 0 0 8 13 27,6,5, 0 浙江 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 3 2 17,4,1, 6 河南 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 2 12,2,9, 1 湖南 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12,2,9, 12 甘肃 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 1 11,2,7, 0 内蒙 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 9,2,2, 0 湖北 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 1 7,1,7, 0 昆明 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 2 5,1,2, 0 重庆 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 3 4,1,0, 0 福建 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 2,0,5, 1 广西 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 2,0,5, 1 黑龙江 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1,0,2, 0 吉林 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1,0,2, 0 辽宁 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1,0,2, 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1,0,2, 0 陕西 413,100,0, 1 1 1 4 3 4 11 11 2 4 67 178 104 22 合计 ,11)16, 条参照序列来源于 表 个 典 型 的 分 支 条 基 了 占 和 ,, ，,， , 33GenBank, N CBI 22 C4a 379 92,21, C4b 于 蛋白的核苷酸序列构建的系统发生树见图 条占 外分支处还有个小分支暂 VP1 ,13 ，3,16,,，C4 4 ， 定为 年湖北分离到的 株属于 可见C4c , shzh0)24、0shzh03)106,C4d、 ,shzh0)14、 1。 ，1987 AF135934 C 基因型年黑龙江 但不属于已知的任何亚型， ,1997 shzh03)105 , 、C4e ,F1)CHN )00 、F2 )CHN )00 , 、C4f 分离到的 株属于 亚型年以后分 AB115494 C3 ，1998 ,shzh04)2、shzh04)3、shzh04)23,。 离到的毒株类 型 除 了 年安徽分离到的 株2008 5 核苷酸与氨 基酸序列 分 析 根据系统进化树的 2,3 和年 湖 北 分 离 到 的结果对相同基因亚型内或不同基因亚型毒株,GQ117124 )128,2009，,,,, 间 区核苷酸与氨基酸进行相似性比较表 VP1 ,3, 。 株属于 型外其余全部是 亚型 除，。GU434678 A C4 表 2 参考毒株信息 Tab,2The information of reference strains 毒株名基因型毒株名基因型登录号 登录号 GenBankGenBank BrCr1970USAA2641)AUS)95AF135947C2U22521 10076Netherlndsa1960 AB524081 B0 2916)TAI)98 AF286526 C2 5603Netherlndsa1965 AB524088 B0 Tainan , 5746 , 98 AF304457 C2 6303Netherlndsa1963 AB524089 B0 TW , 2086 , 98 AF119796 C2 11130Netherlndsa1971 AB524096 B1 97)56)CHN)97 AB115494 C3 Nagoya, J apan73 AB059813 B1 KOR)EV71)3 AY125968 C3 2952)SD)81 AF135888 B2 1089T , VNM , 05 AM490142 C5 MS , 7423 , 87 ETU22522 B2 1301V , VNM , 05 AM490149 C5 MY21 , 2 , SAR , 97 933V , VNM , 05 AM490161 C5 AF376074 B3 SK)EV006 , Malaysia 97 AB059819 B3 E2005125)TW EF063152 C5 NTU1551)TW)06 B4 2027 , SIN , 01 AF376111 DQ846663 C5 B4 5769 , SIN , 00 AF376125 SHZH98 AF302996 C4b C4b 5511)SIN)00 DQ341364 B5 AB115492 H25)CHN)00 C4a S19841)SAR)03 DQ341363 B5 GQ487671 ZH)ETC222 , GD , CHN , 09 C4a 0915)MA)87 AF009549 C1 TC08F , SD , CHN , 07 EU753409 U05876 2623)AUS)86 AF135945 C1 CoxA16 G)10 SB9508)SAR)03 AY258301 C1 型 在 位 发 生 氨基酸位点均有特异性变异 核苷酸水平各个亚型内的核苷酸相似性高2,3,1,A 167 变异位发生 变异位基在 E?D ，282 N?D ， 275 ，A 型内最小相似性为 于亚型间的相似性 ，86,4, : 基 因 型 最 高 相 似 性 为 发 生 变 异 因 型 与 此,,， 、。 88,3, B 99,1, :99,5,AY895130AY895138 A ?S 株一直是 世纪 年代至 年,C2, 。U22521 20 70 2007 ， 外 年 株 安 徽 基 因 型 毒 株 ，,2008 4 A GQ117124 )基因型的唯一毒株年安徽分离到的 EV71 A ，2008 5 株和 毒 株 125， GQ11712)7128,U、22521 GU434678 株核苷酸相似性为 ,GQ11712)4128,99,0,:99,5,， 在 位 发 生 变 异 分 别 在18 R ?K ，GQ117126 )128 高 于 它 们 与 株 的 相 似 性 U22521 ,97,8,:98,7, , ,和 位发生 变异 、，113 164 I?VD?G GQ11712)4128年从湖北分离的 株与 株的 2009 GU434678 U22521 在 位发生 变异年中国大陆 142 P?Y 。 1987)2010 ，核苷酸相似性为 株的 略低于其与安徽的 98,6,， 5 未 分 离 到 的 基 因 型 基因型参考株 分 别EV71 B ，B 相 似 性 暂 定 的 ,98,6,:99,2, ,。 C4c、C4d、C4e、C4f 在 氨 基 酸位点发生特异性的 、、、、4358292164184 与 的核苷酸相似性均高于与 的相似性也 C4b C4a ，变异基因型和 K?E、 A?T、 T?N、 D?E、 S?T 。 C 高于 与 的 相 似 性 其 氨 基 C4a C4b ,91,6,:93,9, , ，部分 基因型在 位点发生特异的 变异B ，240 S?T ， 酸相似性也是如此因此可以把 ， C4c、C4d、C4e、C4f 在 位发生特异的 变异与 比较249 I?V 。 C4a C4b ， 并入 亚型进行分析C4b 。 未发生氨基酸特异性变异从正常儿童的粪便标本。 中获得的 株与其他 型株比较氨基酸 氨基酸水平 各个亚型内的氨基酸相似性高 ，2,3,2HQ129932 C4 未见特异性变异。 于亚型间的相似性 型内最小相似性为 ， 97,2, : 间 基因型最高相似性为 98,3,,B , ， 100,0,,C2, 。 讨 论3 株 与 的 氨基酸相似性分别为 AF135934C3、C2 年 以 来 中 国 大 陆 暴发了手足口病的流 ，均低于 与 的氨 2008 、，90,3,:93,9,90,5,:93,9,C2 C3 作为其主要病原体之一 逐渐得到了广泛行基苷酸相似性 各基因型在特定的，，,,。EV71 98,7,:99,6, 的关注。 目前 分子流行病学主要研究 内容 财务内部控制制度的内容财务内部控制制度的内容人员招聘与配置的内容项目成本控制的内容消防安全演练内容 是衣壳 EV71 蛋白 的基因蛋白是该病毒主要的中和决 VP1 ，VP1 定因子是特异性中和表位的所在区域直接决定病 ，，,12,毒的抗原性虽然有研究表明 和 基因序 ，VP1 VP4 列能提供相似的进化信息但是基于 序列分析 ，VP1 的引导检测值更高可信度更高尤其是在出现新基 ，，,17,因型时更好解释 基因最具研究价值 所 以 ， VP1 。 ,12,等最早依据 核苷酸序列的差异Brown EV71 VP1 ， 将 分为 个基因型条中 本文对 EV71 A、B、C 3 。 411 国 大 陆 来 源 的 核苷酸序列分析发现 EV71 VP1 ， 年安徽及 年湖北均出现了 基因型的流 2008 2009 A 行基因型在中部地区可能流行了一段时 表 明 ， A 间 株 与 株 中 国 型毒株的相似性为 。 U22521 6 A 株中国 型毒株内的相似性低于 97,8,:98,7,， 6 A 暗示中国的 型毒株与美国的 型 98,9,)99,4, ，A A 毒株可能有不同的来源与 的 核 通过 。 C4a C4b VP1 苷酸的比较未见氨基酸发生特异性变异各基因型 ，。 在 等氨基酸 43、58、142、164、167、184、240、249、292 位点发生了特异性的变异病毒进化有 这对 ， EV71 重要意义。 系统进化树的结果表明中国大陆 多年来流 ，20 行的主要是 型仅 年安徽和 年湖北发现 C ，2008 2009 ,18,了 型这提示 型株可能具有更强的传染力A ，C 。 80 年代株 的 流 行 年 中国大陆主要是 ， AF135934 ，90 代 是 基 因 亚 型 年 开 始 出 现 C3 ,AB115494,1998， ,19,基因亚型流行并成为优势毒株近两年的研C4 ，。 图 中国大陆 分离株的系统进化树 1 EV71 The phylogenetic analysisVP1 o gfe ne oEfV 71 virus Fig,1 isolated from mainlandChina 表 相同基因亚型内或不同基因亚型毒株间 区核苷酸与氨基酸的相似性比较 3 ,,,,VP1 ,,, Tab,3VP1 nucleotide and amino acids sequence similarity within o,sur bbe, twgeeenotypn es,,, C5C4bC4aC3C2C1BA C598,8~99,5 97,9~99,5 97,9~99,0 98,9~99,5 98,1~99,2 98,8~99,4 96,7~98,0 95,1~96,9 86,3~89,4 98,6~99,5 98,4~99,7 98,4~99,7 98,4~99,6 98,3~99,6 96,9~98,7 95,0~97,5 C4b 85,0~87,5 91,6~93,9 99,2~99,6 98,3~99,3 98,1~99,2 98,1~99,2 97,0~98,2 95,0~96,9 C4a 87,8~89,8 88,5~91,2 87,3~89,3 98,9~99,7 98,7~99,6 99,0~99,5 97,1~98,3 95,4~97,2 C3 87,7~90,0 88,0~91,6 87,7~89,9 93,3~94,6 100,0 98,6~99,5 96,6~98,0 95,1~97,1 C2 90,2~92,0 89,3~91,7 87,4~89,5 91,0~92,5 98,6~99,5 97,0~98,2 95,6~97,3 90,2~92,0 C1 81,2~83,7 84,1~86,9 86,9~88,7 82,1~84,4 81,6~84,0 97,2~98,3 94,6~96,4 81,6~84,1 B 76,7~80,2 77,3~81,1 78,0~81,4 78,2~81,4 77,5~80,9 77,3~80,4 97,3~98,3 79,2~82,6 A 注亚型内或不同基因 亚型毒株间 区核苷酸相似性 的 比 较 黑体部分为相同基因 其余为氨基酸的相似性比较 , ,,,,VP1 ， 。 C 5、C4b、C4a、C3、亚型内核苷酸的相似性分别为 C2、C1、B、A 97,9,~98,5, 、94,5,~98,6, 、97,4,~97,8, 、91,7,~93,3, 、99,1,~99,5, 、95,0,~96,2, 、86,4,~ 88,3,、98,7,~99,1,。 究 表 明 亚 型又可以细分为 和 主 亚 型 亚 型 明该株既不属于 也 不 属 于 而 属 ，， ， C4 C4a C4bC4b C2 C3 要 流 行 于 年 主 要 流 行 于 年 于 和 中间的一个型别这与多项研究结果一 1998 )2004 ，C4a 2003 C2 C3 ， ,10，20,,12, ,11，16, 至今致 等 的研究认为该株属于 亚 而 。， Brown C2 年于湖北分离到的 株与 型这可能与他所构建的系统进化树中未包括 1987 AF135934 C3、C2 ， C3 ,,10亚型株有关孤儿这样的毒株被称之为孤儿株亚型的核苷酸相似性均低于 与 的相似性说。 ， C2 C3 ， 65,1,13,8)148,株的发现为 的起源和进化以及基因多态性研 EV71 Ishiko H，Shimada Y，Yonaha M，et al,Molecular diagnosis of ,8,究提供了新的方向和证据该株的流行也很可能不 。 human enteroviruses by phylogeny )based classificationby use of 是当时流行的唯一毒株而是代表了一系列同亚型， the VP4sequen ce,J,,J InfectDi s，2002， 185,6,74,4) 754,Tam uraK ， PetersonD ， PetersonN ，et al,MEGA5, 或同型的毒株由于当时技术的落后以及监察力度， ,9,Molecular Evolutionary Genetics An alysis using Maximum ,10, 的缺陷没有分离到别的毒株并测序提交，。Likelihood ，Evolution aryDi stance， and Maximum Parsimony ,21,等发现在 亚型株中只表现 Mcminn C2 ，HFMD Methods ,J,, Mol Biol Evol， 2011，28,10,273,1)2739, 的分离株与具神经毒性的分离株在 位氨基酸存 170 DongX ， Ying J， Chen Y, Molecular epidemiology and evolution 在区别前者为丙氨酸而后者是缬氨酸在，,A,，,V, 。 of worldwide enterovirus 71 strains isolated from 1970 to2004 ,10,,J,, Chinese ScienceBulleti n， 2007， 52,11,148,4)1490, 本 研 究 中 只 有 个 分 离 株和2,GQ253408， ZhangY ，Tan XJ，Wang HY，et al,An outbreak of nhda， foo，t and mouth disease associated with subgenotype C4 of human 位氨基酸位点发生变异在 , ,, 。HM776026170 A?T ,11,enterovirus 71 in Shandong， China,J,,J Clin Virol，2009，44 ,4, , 从正常儿童的粪便标本中获得的 株与其HQ129932 262)267, 他 型株比较 提示氨基酸也未见特异性变异， ，C4 Brown BA，Oberste MS，Alexander JP Jr，et al,Molecular epidemiology and evolution of enterovirus 71 strains isolated from 的 基因与疾病的严重程度无 明 显 关 联 ，EV71 VP1 ,,121970 to199 8,J,,J Virol，1999，73,12,996,9)9975, ,12,因为所有基因型均能引起严重的疾病所以其他 ，Mcminn P，Lindsay K，Perera D，et al,Phylogenetic analysis of 的环境因素社会因素宿主的遗传因素和免疫反应 、、enterovirus 71 strains isolated during linked epidemics in 及病毒载量都会大大影响临床结局。 Malaysia， Singapor，e and WesternA ustralia,J,,J Virol，2001， 75 ,13,,16,773,2)7738, 目前预防和控制 的感染 没有有效的抗，EV71 HuangY P，Lin TL，Kuo CY，et al,The circulation of subgenogroups ,22,病毒药物和疫苗 存 在 由 于 ， 、、EV71 AB1)B5C1)B5 and C5 of enterovirus 71 in Taiwan from 2006 to 2007 ,J,,Virus Res， 2008， 137,2,20,6)212, 基因亚型 因而疫苗的研发 要求 对教师党员的评价套管和固井爆破片与爆破装置仓库管理基本要求三甲医院都需要复审吗 研究不同基因亚，C5 ,14,Li L，He Y，Yang H，et al,Genetic characteristics huof man ,18,型间毒株的抗原性和 型 研究表明。 ，、、AB4B2 C1 enterovirus 71 and coxsackievirus A16 circulating from 1999 to株免疫的动物血清以及病人血清均能中和多种不同 2004 in Shenzhe，nPeople's Republic of China ,J ,,J Clin ,23)25,亚型的 病毒但是中和活性有差别 相同EV71 ，， Microbio，l 2005， 43,8,383,5)3839, ,15,ZhangY ， Zhu Z， Yang W，et a,An emerging recombinhuantm an l 但 是 型 基因型不同亚型间的活性具有相似性 ，B enterovirus 71 responsible for the 2008 outbreak of hanndd foot a,18 , 株 比 型株能产生更高的中和抗体 其 对我国 ， C mouth disease in Fuyang city Cofhi na,J,,Virol J， 2010， 7,,26, 94,C ardosaM J， Perera D， Brown BA，et al, Molecular 大陆近年流行的 株保护效果较差 目前尚无。C4 ,16,epidemiology of human enterovirus 71 str ains and recent outbreaks 亚型疫苗候选疫苗株对其他基因型毒株的交叉 C4a in the Asia-P acific region, comparative analysis ofVP1 the and 保护作用因此应加强这方面的研究，。 VP4 genes ,J,,Emerg InfectDi s， 2003， 9,4,46,1)468, ,17,Mizuta K，Aoki Y，Suto A，et a,Cross-antigenicity amongEV71 l 参考文献 strains from different genogroupsisola ted in Yamagata ， Jap an， ,1,Wong S，SYip CC，Lau SK，et al,Human enterovirus 71 andh and，between 1990 a200nd 7,J,,Vaccine，2009， 27,24,315,3)foot and mouth disea,se J,, Epidemiol Infect，2010，138 ,8, ,3158,Ya ng F，Jin Q，He YQ，et a,The complete genome of l1071)1089, ,18,Enterovirus Schmidt NJ，Lennette EH，Ho HH,An apparently new enterovirus ,2,71 China strain ,J,,Sci China Ser C-Life Sci，2001，44 ,2,178, ) isolated from patientswith disease of the trcenal nervous system 183, ,J,,J InfectDi s，1974，129,3,30,4)309, 崔 爱 利 肠 道 病 毒 型 的 诊 断 许 文 波 李 秀 珠 等， ， ， , 71 RT-PCR ,19,Lee MS， Chang LY, Development of enterovirus 71 vaccines 及基因特征病毒学报,J,,， 2004， 20,2,16,0)165, ,3,,J,,Expert Rev Vaccines， 2010， 9,2,14,9)156, Mcminn P，Lindsay K，Perera D，et a,Phylogenetic analysis of l中华人民共和国卫生部年法定传染病疫情 报告 软件系统测试报告下载sgs报告如何下载关于路面塌陷情况报告535n,sgs报告怎么下载竣工报告下载 北 , 2010 ,R,, enterovirus 71 strains isolated during linked epidemics in 京,2010, ,4, ,20,Malaysia， Singapor，e and WesternA ustralia,J,,J Virol，2001， 75 ObersteM S， Penaranda ， S Maher K，et a,Complete genome l,16,773,2)7738, sequences of a members of the species Human enteroA ,virusJ,,J ll ,5, ,21,Mcminn PC, An overview of theevolut ion of enterovirus 71 andi ts GenVi rol，2004，85,Pt 6,159,7)1607, clinical and public health significance,J,, FEMS Microbiol Re， vObersteM S，Maher K，Kilpatrick DR，et al,Typing of human 2002， 26,1,9,1)107, enterovruses by partia sequencing VP1of ,J,,J Clin Microbio，l il ,6,1999，37,5,128,8)1293, ,22,CasasI ，Palacios GF，Trallero G，et al,Molecular characterization of human enteroviruses in clinical samples , co mpriason between VP2， VP1， and RNA polymerase regions usingRT nested PCR ,7, assays and direct sequencing of products,J ,, J MedVi rol， 2001， ,23,Arita M，Shimizu H，Nagata N，et a,Temperature-sensitivel mutants of enterovirus 71 show attenuationin cyno molgus mkeyson ,J,, J GenVi rol， 2005， 86,15,139,1)1401, 下 转 第 页 ,1353 , 计算出的 年 月天心区肺结 核发病的模拟模型和 常微分方程模型 回归模，、、2011 1)4 ARIMASIR SEIR ,4)6,核发病数与实际值均在置信区间内说明该模型对 ， 灰色动态模型神经网络模型等型多因素疫情、、。 未来的情况进行了很好的跟踪与预测预测的 。 2011 预测模型可以通过观察和改变各要素的水平对疫情 年 月至 年 月的肺结核月发病数能够为疫 5 2010 4 发展的影响程度来分析和评价各要素在结核病控制 情的防控提供科学参考模型模拟的由于 。 ARIMA 策略中的作用模拟结核病流行特点和流行过程预,， 但多因素模型对数据资料的要求许多传染病与肺结核测疫情发展趋势是疾病发病时间变化的趋势。， 较高需要采集肺结核流行过程中诸多因素的数据的发病特点类似也具有季节性因此本文建立的，，，，， 模型也适用于其他疾病ARIMA 。 并作动态观察但预测精度较回归模型简单易行。 ， 差可处理一维时间序列灰色模型所需数据量小。 ，， 预测精度优于回归模型但对于季节周期性数据提 参考文献， ,7,吴本权唐先锋刘慧等以社区获得性肺炎为表现的肺结核 取信息较少模型是针对有时间性变动的 ，，，, 。 ARIMA ,1, 的临床特点热带医学杂志,J,,， 2009， 9,3, ,288)291, 序列提出的建模方法对每一个季节周期中同时间 ， 孙振球徐勇勇医学统计学第 版北京人民卫生出 ，, ,M,, 2 ,, ,2,点的序列值进行分析提取季节趋势并针对每个季，, 版社， 2007, 温亮徐德忠林明和等应用时间序列模型预测疟区疟疾发 ，，，, 是精节周期内部序列值的变化提取非季节性成分， ,3,病率第四军医大学学报,J,,，2004，25,6, ,507)510, ,8, 确度较高的预测模型但缺点是计算相对复杂不，。 谭旭辉柳青传染病预测和决策系统研究国外医学社会 ，,,J,,? ,4,过大部分的计算均可以采用统计学软件包 或 ，SPSS 医学分册，2005，22,1,3,4)38, 贺晓新金水高张立兴等结核病疫情发展预测模型的建立 ，，，,进行分析因此对于肺结核预测的研究模型 SAS ，，， 及评价中国防痨杂志,J,,，2004，26,1,1,0)15, ,5,采用 季节性模型是较为适合的ARIMA 。 宋烨杨本付李芳等应用人工神经网络技术诊断涂阴肺结 ，，，,本研究通过模型识别参数估计模型诊断 个、、3 核的研究热带医学杂志,J,, ，2007， 7,3,23,5)238, ,6,张彦琦唐贵立王文昌等模型及其在肺结核预测中 ，，，,ARIMA 步骤建立 季节性模型 对天心区肺结核发，ARIMA 的应用现代预防医学,J,,，2008， 35,9, ,1608)1615, ,7,病情况进行模拟和 进行模型诊断 通过 ， ，AIC SBC 刑慧娴杨维中王汉章传染病预测预防医学情报杂志，，,,J,,， 2004，29,6,63,9)642, 得出最适合模型以期达到预测肺结核发病趋势的， ,8,收稿日期,2011)06)23 目的年的肺结核发病数据进行拟 选择 。 2003)2010 合建立了 模型结果表明，ARIMA ，，ARIMA ,1，0，1, 模型可以较好运用于天心区肺结×AMA,0，1，1, RI12 !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! ,上 接 第 页 , 1345 ,24, Foo DG， AlonsoS ， ChowV T，et al, Passive protection against,J,,Clin Microbio Infect ，200 7， 13,8,78,2)787,l lethal enterovirus71 infection in newborn mice by neutralizing Ong KC，Devi S，Cardos aMJ，et al,Formaldehyde-inactivated ,26,antibodies elicited by a synthetic peptide,J , , Microbes Infect ， whole-virus vaccine protects a murine model of enterovirus71 encephalomyelitis against disease,J,,J Viro l，2010， 84 ,1,66,1) 2007， 9,11,129,9)1306, 665, ,25, Kung SH，Wang SF，Huang CW，et al, Genetic and antigenic 收稿日期analyses of enterovirus 71 isolates in Taiwan during 1998 )2005 ,2011)07)11