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辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析

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辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析园艺学报,2016,43(8):1504–1512.ActaHorticulturaeSinica1504doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0207;http://www.ahs.ac.cn收稿日期:2016–06–02;修回日期:2016–08–03基金项目:国家自然科学基金项目(31560555);农业部园艺作物生物学与种质创制学科群西北地区蔬菜科学观测试验站项目(2015-A2621-620321-G1203-06...

辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析
园艺学报,2016,43(8):1504–1512.ActaHorticulturaeSinica1504doi:10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0207;http://www.ahs.ac.cn收稿日期:2016–06–02;修回日期:2016–08–03基金项目:国家自然科学基金项目(31560555);农业部园艺作物生物学与种质创制学科群西北地区蔬菜科学观测试验站项目(2015-A2621-620321-G1203-066);甘肃省农业科学院科技创新工程学科团队项目(2015GAAS01);甘肃省农业科学院中青年基金项目(2014GAAS27)*通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:zjn0101@sina.com)辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析魏兵强1,2,王兰兰2,张茹2,陈灵芝2,张少丽2,张建农1,*(1甘肃农业大学园艺学院,兰州730070;2甘肃省农业科学院蔬菜研究所,兰州730070)摘要:利用生物信息学方法,从辣椒全基因组数据库中共鉴定出11个辣椒TPS基因,除CaTPS3含有1个TPS和2个TPP结构域外,其余分别含有1个TPS和1个TPP结构域。11个CaTPS分为2类,ClassⅠ包含3个基因(CaTPS1~CaTPS3),分别含有16、16和13个内含子,CaTPS1和CaTPS2含Motif1~Motif5各1个,而CaTPS3含有2个Motif4和1个Motif3。ClassⅡ包含8个基因(CaTPS4~CaTPS11),均含有2个内含子,且分别含Motif1~Motif6各1个。利用荧光定量PCR对CaTPS1在辣椒组织表达的特异性和低温应答模式进行分析,结果表明:CaTPS1在叶片中的表达量大约是根和茎中的5~6倍,说明CaTPS1的表达具有明显的组织特异性;低温处理后CaTPS1在根和茎中的表达高峰出现时间明显早于叶片,说明不同组织中CaTPS1对低温胁迫的应答时间存在一定差异。关键词:辣椒;海藻糖–6–磷酸合成酶基因;全基因组鉴定;基因表达中图分类号:S641.3文献标志码:A文章编号:0513-353X(2016)08-1504-09IdentificationofCaTPSGeneFamilyandExpressionAnalysisofCaTPS1inHotPepperWEIBing-qiang1,2,WANGLan-lan2,ZHANGRu2,CHENLing-zhi2,ZHANGShao-li2,andZHANGJian-nong1,*(1CollegeofHorticulture,GansuAgriculturalUniversity,Lanzhou730070,China;2InstituteofVegetable,GansuAcademyofAgriculturalSciences,Lanzhou730070,China)Abstract:Trehaloseandtheprecursortrehalose-6-phosphateparticipateinrespondingtoabioticstressastheosmoticregulatorandthesignalingmolecule.Trehalose-6-phosphatesynthase(TPS)isoneofthemostimportantenzymeamongthesynthesismechanismoftrehalose-6-phosphate,andplaysanimportantroleinthemetabolicpathwayoftrehalose.TheoverexpressionofTPSgenecanimprovecrop’stolerancetoabioticstress.Basedonpeppergenomedatabase,11genesofCaTPSfamilywereidentifiedbybioinformaticsmethods.BesidesCaTPS3containsoneTPSandtwoTPPdomains,therestof10CaTPSfamilygenescontainoneTPSandoneTPPdomain.All11CaTPSfamilygeneswereclassifiedintotwoclassesaccordingtotheirgenestructureandphenogenesis.CaTPS1,CaTPS2andCaTPS3aregroupedtoClassⅠ.CaTPS1andCaTPS2respectivelycontains16intronsand5motifsfrommotif1tomotif5,whileCaTPS3contains13introns,onemotif3andtwomotif4.TheresteightgenesfromCaTPS4toCaTPS11魏兵强,王兰兰,张茹,陈灵芝,张少丽,张建农.辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析.园艺学报,2016,43(8):1504–1512.1505respectivelycontainstwointronsandsixmotifsfrommotif1tomotif6,andtheyaregroupedtoClassⅡ.TheexpressionoftissuespecificityandresponsetolowtemperaturestressofCaTPS1wereanalyzedinhotpepperusingquantitativereal-timePCR.TheresultsshowedthattheexpressivequantityofCaTPS1geneinleaveswerefivetosixtimesthanthatinstemsandroots,thisindicatedthattheexpressionofCaTPS1appearedobvioustissuespecificityinhotpepper.Aftertreatedwithlowtemperature,theexpressingpeakofCaTPS1inrootsandstemsappearedearlierthanthatinleaves,whichsuggestedthattherespondingtimestoabioticstressofCaTPS1werenoaccordancebetweendifferenttissues.Keywords:hotpepper;trehalose-6-phosphatesynthasegene;genomicidentification;geneexpression海藻糖(trehalose)是广泛存在于生物体中由2个分子葡萄糖组成的非还原性双糖,它不仅能在适宜环境下为生物体的新陈代谢提供和储存能量,也能在生物体处于逆境时(如高寒、高盐、高温和干燥失水等)有效地保护生物膜及蛋白质等生物大分子结构和功能的稳定,对生物体起着不可替代的抗逆保护作用(Croweetal.,1996;Lerbretetal.,2005;Alpert,2006;Sundaramurthietal.,2010;Hackeletal.,2012)。海藻糖在细菌中有多个合成途径,而在真菌、植物和动物中只有1个合成途径。在植物体内海藻糖主要经TPS/TPP途径合成,首先由海藻糖–6–磷酸合成酶(trehalose-6-phosphatesynthase,TPS)催化尿苷二磷酸–葡萄糖与葡萄糖–6–磷酸形成海藻糖–6–磷酸(trehalose-6-phosphate,T6P),然后再由海藻糖–6–磷酸磷酸酶(trehalose-6-phosphatephosphatase,TPP)催化T6P脱磷酸形成海藻糖(Virgilioetal.,1994)。已在许多植物中发现了TPS/TPP海藻糖合成途径中酶的编码基因,植物基因组中含有大量具有TPS和TPP结构域的基因。TPS是T6P合成途径中的关键酶,TPS基因的过表达能明显提高作物的非生物胁迫适应性。此外,植物中的TPS基因都以基因家族的形式存在,且大多数植物TPS基因家族中,只有TPS1具有TPS活性。本试验中利用生物信息学手段分析鉴定了辣椒TPS家族成员,分析其成员分类、染色体定位、基因结构和模体组成,对CaTPS1的低温胁迫表达模式进行分析,以期为进一步研究辣椒CaTPS功能及抗逆分子机理提供一定参考。1材料与方法1.1材料试验所用辣椒品种为甘肃省农业科学院蔬菜研究所选育的‘陇椒3号’,耐寒性强。辣椒全基因组数据来源于ThePepperGenomeDatebase(http://peppersequence.genomics.cn/)(Qinetal.,2015)。水稻(Oryzasativa)与拟南芥的TPS基因和蛋白序列分别来源于TIGR(http://www.rice.plantbiology.msu.edu/)(Ouyangetal.,2007)和TAIR(http://www.arabidopsis.org/)(Hualaetal.,2001)。1.2辣椒TPS基因家族成员的鉴定以双子叶植物拟南芥和单子叶植物水稻中已鉴定的所有TPS基因家族成员cDNA序列为模板,在ThePepperGenomeDatebase中进行tblastn,获得辣椒TPS相关基因,进一步利用Pfam数据库工具进行TPS结构域验证,获得辣椒所有TPS基因家族成员,利用DNAMAN6.0软件,根据与拟南芥TPS基因家族成员的同源性进行系统命名。WeiBing-qiang,WangLan-lan,ZhangRu,ChenLing-zhi,ZhangShao-li,ZhangJian-nongIdentificationofCaTPSgenefamilyandexpressionanalysisofCaTPS1inhotpepper.1506ActaHorticulturaeSinica,2016,43(8):1504–1512.1.3辣椒TPS编码蛋白的系统发育分析以拟南芥和水稻TPS亚家族成员蛋白序列为参照,运用BioEditV7.0.1软件对辣椒TPS家族蛋白序列进行联配分析,联配结果使用MEGAV5.1,采用邻接法生成TPS的系统进化树,校验参数bootstrap值设置为重复1000次。1.4模体(Motif)结构分析以辣椒TPS家族成员蛋白序列为参照,通过MEME网站(meme.nbcr.net/meme/intro.html)进行模体结构分析。MEM分析时蛋白质序列内部不能存在空位,每个位置上可能出现的字母构成一个位置特异性概率矩阵(PSPM),利用该矩阵判断序列组中可能存在的模体。参数设计时模体基序长度最小为10,最大为100,保守序列发现数最大为6。1.5基因结构分析以辣椒TPS家族成员基因组序列和编码区序列为参照,通过基因结构预测网站(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)进行基因结构分析(Huetal.,2015)。网站预测时将基因组序列和编码区序列分别转化为FASTA格式,同时保证同一基因的两种序列一一对应。1.6CaTPS1的分离与表达分析对初花期辣椒苗进行8℃低温处理,同时以未处理植株为对照。采用植物总RNA快速抽提试剂盒(生工,上海)分别提取经不同时间(0、1、6、12、24和48h)处理及未处理的辣椒叶、茎和根RNA,用TIANScriptⅡcDNA第一链合成试剂盒(天根,北京)反转录成cDNA。以辣椒参考基因组中鉴定到的CaTPS1序列设计合成引物(F:TAGGATCCATGCCGGGGAACAAGTAT,R:GCGTCGACTCATGATGCCCCATT,下划线表示酶切位点),扩增克隆CaTPS1序列,送华大基因科技有限公司(北京)测序。根据测序结果,设计合成荧光定量PCR引物(qF:GACGAGACCTCCACCAC,qR:GCCCATCAGACAACGAC),以辣椒Actin(GenBankAccession:GQ339766.1)为内参基因(qAcF:ATTCAGGCTGTTCTTTCC,qAcR:AGCATAACCCTCATAGATAG),分别对经上述不同时间低温处理的叶、茎和根cDNA进行qRT-PCR分析。采用2-∆∆Ct法(张丹等,2013)计算相对表达量。2结果与分析2.1辣椒TPS基因家族成员的鉴定与分类通过生物信息学分析,从辣椒全基因组中共鉴定得到11个TPS家族成员(表1),其中有3个分布于染色体7上,有6个分别分布于染色体1、2、5、8、10和11上,另外有2个未能定位。通过NCBI-CDD和PFAM工具进行蛋白结构域分析,11个辣椒TPS蛋白都含有TPS(Pfam:Glyco-transf-20)和TPP(Pfam:Trehalose-PPase)两个典型特征结构域,其中CaTPS3含有1个TPS和2个TPP结构域。根据与双子叶植物拟南芥相关TPS蛋白的同源性,将11个辣椒CaTPS基因分别命名为CaTPS1~CaTPS11。辣椒11个CaTPS基因编码蛋白质长度范围从679个氨基酸(CaTPS3)到929个氨基酸(CaTPS1),分子量从77.17kD(CaTPS3)到104.71kD(CaTPS1),等电点从5.38(CaTPS7)到8.71(CaTPS3)。魏兵强,王兰兰,张茹,陈灵芝,张少丽,张建农.辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析.园艺学报,2016,43(8):1504–1512.1507表1辣椒TPS基因家族成员基本信息Table1BasicinformationofTPSfamilygenesinpepper基因Gene基因序列号GeneIDnumber染色体Chromo-someTPS结构域位置TPSdomainlocationTPP结构域位置TPPdomainlocation氨基酸数Numberofaminoacid分子量/kDMolecularmasspICaTPS1Capana07g002060792~557592~751929104.716.08CaTPS2Capana00g002284–107~536582~793903101.796.06CaTPS3Capana00g001034–258~32374~255;369~56967977.178.71CaTPS4Capana01g001057159~545595~82986297.215.82CaTPS5Capana08g000100863~552602~83685797.245.74CaTPS6Capana10g0002931062~545595~858885100.885.86CaTPS7Capana07g001806761~544594~82585296.645.38CaTPS8Capana02g001649259~542592~82685096.235.65CaTPS9Capana05g001390554~537587~83286797.605.63CaTPS10Capana11g0013621159~542592~82585696.716.21CaTPS11Capana07g000086760~544595~83087598.306.042.2辣椒TPS蛋白的系统发育分析系统发育分析表明,辣椒11个TPS蛋白家族成员分为2大类,参照拟南芥的研究结果,将两类家族命名为ClassⅠ和ClassⅡ。ClassⅠ包含CaTPS1~CaTPS3,其余8个成员都包含在ClassⅡ(图1)。辣椒TPS蛋白家族成员进化结果与拟南芥、杨树、大豆和水稻中的分析结果(Lunnetal.,2007;Zangetal.,2011;Xieetal.,2012;谢翎等,2014)基本一致。图1辣椒TPS基因家族编码蛋白CaTPS系统进化树Fig.1PhenogenetictreeofTPSinpepper此外,ClassⅠ中CaTPS1~CaTPS3均含有较多的内含子,分别为16、16和13,ClassⅡ中所有成员均含有2个内含子(图2)。该结果与拟南芥、杨树和水稻中的研究结果吻合(Lunnetal.,2007;Zangetal.,2011;Xieetal.,2012)。以上结果说明植物ClassⅠ和ClassⅡ经历了不同的进化方式。2.3CaTPS基因家族蛋白模体分析通过模体分析网站MEME对CaTPS基因家族蛋白进行Motif分析,11个成员中共找到6个Motif(Motif1~Motif6)(图3)。除CaTPS3外,其余10个成员均含有Motif1~Motif5,且排列顺序完全一致,Motif1~Motif4定位于TPS结构域中,而Motif5定位于TPP结构域中。CaTPS3含有WeiBing-qiang,WangLan-lan,ZhangRu,ChenLing-zhi,ZhangShao-li,ZhangJian-nongIdentificationofCaTPSgenefamilyandexpressionanalysisofCaTPS1inhotpepper.1508ActaHorticulturaeSinica,2016,43(8):1504–1512.1个Motif4,定位于TPS结构域中,同时含有2个Motif3,分别定位于其2个TPP结构域中。除此之外,ClassⅡ的8个成员中均存在1个特有的Motif6,紧挨Motif4,横跨TPS和TPP间区至TPP前端氨基酸,是Motif成员中最长的Motif。图2辣椒TPS家族成员的基因结构Fig.2GenestructureofTPSfamilygenesinpepper图3辣椒TPS基因家族模体及模体分布图Fig.3MotifsandtheirdistributionofTPSfamilyinpepper2.4CaTPS1的表达分析根据辣椒基因组数据库(http://peppersequence.genomics.cn/)鉴定得到CaTPS的家族成员cDNA序列,设计引物,成功克隆出CaTPS1(GenBankaccessionnumber:KU568375)。测序表明CaTPS1的cDNA全长2790bp,与参考基因组中鉴定到的该基因序列完全一致(图4)。利用荧光定量PCR技术,对CaTPS1的组织特异性进行分析,结果表明:CaTPS1在辣椒幼苗根、茎、叶组织中都有表达,在叶片中的表达量最高,大约是根和茎中的5~6倍,而根和茎中的表达量基本相同(图5)。魏兵强,王兰兰,张茹,陈灵芝,张少丽,张建农.辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析.园艺学报,2016,43(8):1504–1512.1509对初花期辣椒植株进行低温(8℃)处理,分析CaTPS1在不同处理时间的表达情况(图6)。对照植株根、茎和叶中的CaTPS1在不同时间点的表达量基本不变,而在低温胁迫下出现了较为明显的变化。低温胁迫下,在叶片中的表达基本上呈先下降再升高的趋势,在48h达到最高,相对表达量是0h的1.74倍;而在茎和根中的表达基本呈先上升后下降的变化,分别于12h和6h在茎和根中的表达量达到最高,分别是0h的2.07倍和2.14倍;低温处理后在根和茎中的表达高峰出现时间明显早于叶片,说明不同组织中CaTPS1对低温胁迫的应答时间存在一定差异。图6低温处理不同时间CaTPS1在辣椒叶、茎和根中的相对表达量Fig.6TheexpressionofCaTPS1ofdifferenttreattimeswithlowtemperatureindifferenttissues图4CaTPS1基因扩增电泳图1:未经低温处理的叶片;2:低温处理的叶片;M:DNAmarkerⅢ。Fig.4ElectrophoregramofCaTPS11:Non-treatedleaves;2:Chilling-treatedleaves;M:DNAmarkerⅢ.图5CaTPS1在不同组织中的特异性表达Fig.5TheexpressionofCaTPS1indifferenttissuesWeiBing-qiang,WangLan-lan,ZhangRu,ChenLing-zhi,ZhangShao-li,ZhangJian-nongIdentificationofCaTPSgenefamilyandexpressionanalysisofCaTPS1inhotpepper.1510ActaHorticulturaeSinica,2016,43(8):1504–1512.3讨论植物中的TPS基因都以基因家族的形式存在。已测序的物种中,大豆中发现了20个TPS基因,蓖麻中发现了13个,冬小麦中发现了12个,而拟南芥、高粱和水稻中均发现了11个,大部分TPS蛋白具有TPS(Pfam:Glyco_transf_20)和TPP(Pfam:Trehalose_PPase)典型特征结构域(Lunnetal.,2007;Liesetal.,2010;Zangetal.,2011;Zhuangetal.,2012;谢翎等,2014;Xieetal.,2015)。TPS蛋白分为两个具有显著区别的类群ClassⅠ和ClassⅡ。酵母只有TPS1属于ClassⅠ;单子叶植物水稻中,只有OsTPS1属于ClassⅠ,其他成员都属于ClassⅡ;双子叶植物拟南芥中则有4个TPS基因(AtTPS1~AtTPS4)属于ClassⅠ(Yangetal.,2012)。本试验中共鉴定出11个辣椒TPS基因,与水稻和拟南芥中TPS基因数(Liesetal.,2010;Zangetal.,2011)一致。辣椒11个CaTPS基因中,有3个(CaTPS1~CaTPS3)属于ClassⅠ,其余8个属于ClassⅡ,辣椒TPS蛋白家族成员进化结果与拟南芥(Liesetal.,2010)、杨树(Lunnetal.,2007)、大豆(谢翎等,2014)和水稻(Zangetal.,2011)中的分析结果基本一致。此外,ClassⅠ中CaTPS1、CaTPS2和CaTPS3均含较多的内含子,分别为16、16和13,而ClassⅡ中所有成员均含有2个内含子,该结果也与拟南芥、杨树和水稻中的研究结果吻合,且ClassⅡ中的基因比ClassⅠ多1个较长模体,说明ClassⅠ和ClassⅡ经历了不同的进化模式,或者根据蛋白质编码基因起源的早期内含子模型解释,8个属于ClassⅡ的CaTPS基因在进化过程中可能承受了较强的选择性压力,造成部分内含子丢失(Zhaxybayeva&Gogarten,2003)。在水稻和拟南芥中,只有TPS1具有TPS活性,因此推测大多数植物TPS基因家族中,只有TPS1具有TPS活性(Ramonetal.,2009;Vandesteeneetal.,2010;Zangetal.,2011)。本试验中从辣椒CaTPS1的组织特异性和低温胁迫应答模式的分析来看,CaTPS1的表达存在组织特异性,且在不同组织中对低温应答反应的敏感性不同,总体来说,在叶中的表达量最高,这与拟南芥、棉花和碱茅中的研究结果不太一致,可能是由于作物不同而导致其表达特异性也不尽相同(Liesetal.,2010;谢翎等,2014;李莹和柳参奎,2015)。当植物遭受诸如干旱、低温等逆境胁迫时,体内会产生一系列渗透调节物质来维持细胞的正常膨压,这些渗透调节物质一类为从外界进入的无机离子,另一类为自身合成的有机物质,如脯氨酸、甜菜碱、甘露醇和海藻糖等。海藻糖是一种典型的应激代谢产物,当植物受到外界不良环境的刺激时,体内的海藻糖含量迅速增加,从而起到保护作用(Vanlaere,1989)。TPS是海藻糖合成途径中的关键酶,TPS基因的过表达能明显增加作物的抗逆性。番茄中过表达TPS和TPP融合基因,对干旱和盐胁迫的耐受性与光合作用都增强(Lyuetal.,2013);冷冻能够诱导冬小麦TPS基因的表达,从而提示TPS基因参与了冬小麦抗冻的信号传导途径(Xieetal.,2015);转AtTPS1烟草分别在镉和铜胁迫下,叶片中丙二醛含量显著下降,而可溶性蛋白含量明显上升,表现出较好的镉、铜耐受性(Martinsetal.,2013);水稻中OsTPS1过表达,幼苗对低温、高盐以及干旱的耐受性增强,同时转基因植株中的海藻糖和脯氨酸含量比野生型高,一些胁迫相关基因也发生了上调表达,包括WSI18、RAB16C、HSP70和ELIP(Lietal.,2011)。因此,TPS基因可能是通过调节其他胁迫相关基因的表达,以及提高海藻糖、脯氨酸、可溶性蛋白等渗透调节物质的含量,来增强植物的胁迫耐受性。对辣椒TPS家族成员的全面了解,有利于全面了解CaTPS参与辣椒非生物胁迫应答的代谢机理,同时为利用转CaTPS基因提高辣椒抗逆性奠定基础。魏兵强,王兰兰,张茹,陈灵芝,张少丽,张建农.辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析.园艺学报,2016,43(8):1504–1512.1511ReferencesAlpertP.2006.Constraintsoftolerance:whyaredesiccation-tolerantorganismssosmallorrare?JExpBiol,209(9):1575–1584.CroweLM,ReidDS,CroweJH.1996.Istrehalosespecialforpreservingdrybiomaterials?BiophysJ,71:2087–2093.HackelC,ZinkevichT,BeltonP,AchillesA,ReichertD,KrushelnitskyA.2012.Thetrehalosecoatingeffectontheinternalproteindynamics.PhysChemChemPhys,14(8):2727–2734.HuB,JinJP,GuoAY,ZhangH,LuoJC,GaoG.2015.GSDS2.0:anupgradedgenefeaturevisualizationserver.Bioinformatics,31(8):1296–1297.HualaE,DickermanAW,Garcia-HernandezM.2001.TheArabidopsisinformationresource(TAIR):acomprehensivedatabaseandweb-basedinformationretrievalanalysisandvisualizationsystemforamodelplant.NucleicAcidsResearch,29(1):102–105.LerbretA,BordatP,AffouardF,GuinetY,HedouxA,PaccouL,PrevostD,DescampsM.2005.Influenceofhomologousdisaccharidesonthehydrogen-bondnetworkofwater:complementaryRamanscatteringexperimentsandmoleculardynamicssimulations.CarbohydrRes,340:881–887.LiHW,ZangBS,DengXW,WangXP.2011.Overexpressionofthetrehalose-6-phosphatesynthasegeneOsTPS1enhancesabioticstresstoleranceinrice.Planta,234:1007–1018.LiYing,LiuCan-kui.2015.CloningofaTPSgeneandanalysisofitsfunctioninstresstoleranceinPuccinelliatenuiflora.ActaPrataculuraeSinica,24(1):99–106.(inChinese)李莹,柳参奎.2015.碱茅6–磷酸海藻糖合成酶基因的克隆及其耐逆性分析.草业学报,24(1):99–106.LiesV,MatthewR,KatrienLeR.2010.Asingleactivetrehalose-6-psynthase(TPS)andafamilyofputativeregulatoryTPS-likeproteinsinArabidopsis.MolecularPlant,3(2):406–419.LunnJE.2007.Genefamiliesandevolutionoftrehalosemetabolisminplants.FunctionalPlantBiology,34(6):550–563.LyuJI,MinSR,LeeJH,LimYH,KimJK,BaeCH,LiuJR.2013.Overexpressionofatrehalose-6-phosphatesynthase/phosphatasefusiongeneenhancestoleranceandphotosynthesisduringdroughtandsaltstresswithoutgrowthaberrationsintomato.PlantCellTissOrganCult,112(2):257–262.MartinsMCM,HejaziM,FettkeJ,SteupM,FeilR,KrauseU,ArrivaultS,VoslohD,FigueroaCM,IvakovA,YadavUP,PiquesM,MetznerD,StittM,LunnJE.2013.FeedbackinhibitionofstarchdegradationinArabidopsisleavesmediatedbytrehalose6-phosphate,PlantPhysiologyPreview,163(3):1142–1163.OuyangS,ZhuW,HamiltonJ.2007.TheTIGRricegenomeannotationresource:improvementsandnewfeatures.NucleicAcidsResearch,35:883–887.QinC,YuCS,ShenYO,FangXD,ChenL,MinJM,ChengJW,ZhaoSC,XuM,LuoY,YangYL,WuZM,MaoLK,WuHY,Ling-HuCY,ZhouHK,LinHJ,González-MoralesS,Trejo-SaavedraDL,TianH,TangX,ZhaoMJ,HuangZY,ZhouAW,YaoXM,CuiJJ,LiWQ,ChenZ,FengYQ,NiuYC,BiSM,YangXW,LiWP,CaiHM,LuoXR,Montes-HernándezS,Leyva-GonzálezMA,XiongZQ,HeXJ,BaiLJ,TanS,TangXQ,LiuD,LiuJW,ZhangSX,ChenMS,ZhangL,ZhangL,ZhangYC,LiaoWQ,ZhangY,WangM,LvXD,WenB,LiuHJ,LuanHM,ZhangYG,YangS,WangXD,XuJH,LiXQ,LiSC,WangJY,PalloixA,BoslandPW,LiYR,KroghA,Rivera-BustamanteRF,Herrera-EstrellaL,YinY,YuJP,HuKL,ZhangZM.2014.Whole-genomesequencingofcultivatedandwildpeppersprovidesinsightsintoCapsicumdomesticationandspecialization.PNAS,111(14):5135–5140.RamonM,DeSmetI,VandesteeneL,NaudtsM,LeymanB.2009.ExtensiveexpressionregulationandlackofheterologousenzymaticactivityoftheclassIItrehalosemetabolismproteinsfromArabidopsisthaliana.PlantCellEnviron,32:1015–1132.SundaramurthiP,PatapoffTW,SuryanarayananR.2010.Crystallizationoftrehaloseinfrozensolutionsanditsphasebehaviorduringdrying.PharmRes,27:2374–2383.VandesteeneL,RamonM,LeRoyK.2010.Asingleactivetrehalose-6-Psynthase(TPS)andafamilyofputativeregulatoryTPS-likeproteinsinArabidopsis.MolecularPlant,3(2):406–419.VanlaereA.1989.Trehalose,reserveand/orstressmetabolite.FEMSMicrobiolLett,63(3):201–210.WeiBing-qiang,WangLan-lan,ZhangRu,ChenLing-zhi,ZhangShao-li,ZhangJian-nongIdentificationofCaTPSgenefamilyandexpressionanalysisofCaTPS1inhotpepper.1512ActaHorticulturaeSinica,2016,43(8):1504–1512.VirgilioC,HottigerT,DominguezJ,BollerT,WiemkenA.1994.Theroleoftrehalosesynthesisfortheacquisitionofthermotoleranceinyeast.Ⅰ.Geneticevidencethattrehaloseisathermoprotectant.EuropeanJournalofBiochem,219(12):179–186.XieDW,WangXN,FuLS,SunJ,ZhengW,LiZF.2015.Identificationofthetrehalose-6-phosphatesynthasegenefamilyinwinterwheatandexpressionanalysisunderconditionsoffreezingstress.JournalofGenetics,94(1):55–65.XieLing,WangZhang-xun,HuangBo.2014.Genome-wideidentificationclassificationandexpressionofTPSfamilygenesinsoybean.ChineseJournalofOilCropSciences,36(2):160–167.(inChinese)谢翎,汪章勋,黄渤.2014.大豆TPS基因家族全基因组鉴定、分类与表达分析.中国油料作物学报,36(2):160–167.YangHL,LiuYJ,WangCL.2012.Molecularevolutionoftrehalose-6-phosphatesynthase(TPS)genefamilyinpopulus,Arabidopsisandrice.PLoSONE,7(8):e42438.ZangB,LiH,LiW.2011.Analysisoftrehalose-6-phosphatesynt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论文 政研论文下载论文大学下载论文大学下载关于长拳的论文浙大论文封面下载 、综述、简报等。设有作物遗传育种·种质资源·分子遗传学;耕作栽培·生理生化·农业信息技术;植物保护;土壤肥料·节水灌溉·农业生态环境;园艺;贮藏·保鲜·加工;畜牧·兽医·资源昆虫等栏目。读者对象为国内外农业科研院(所)、大专院校的科研、教学与管理人员。《中国农业科学》中文版为半月刊,影响因子、总被引频次连续多年居全国农业科技期刊最前列或前列位次。为北京大学图书馆1992—2014年连续7次遴选的核心期刊,位居《中文核心期刊要目总览》“农业综合类核心期刊表”的首位。1999—2008、2013—2014年获“国家自然科学基金重点学术期刊专项基金”资助;2015年获“中国科协精品科技期刊工程项目”资助。1999年获“首届国家期刊奖”,2003、2005年获“第二、三届国家期刊奖提名奖”;2002—2015年先后13次被中国科学技术信息研究所授予“百种中国杰出学术期刊”称号;2009年获中国期刊协会/中国出版科学研究院“新中国60年有影响力的期刊”称号;2010、2013年荣获“第二、三届中国出版政府奖期刊提名奖”,2013年获新闻出版广电总局“百强科技期刊”称号;2012、2013、2014、2015年获清华大学图书馆等“2012、2013、2014、2015中国最具国际影响力学术期刊”称号。《中国农业科学》中文版大16开,每月1、16日出版,国内外公开发行。每期208页,定价49.50元,全年定价1188.00元。国内统一连续出版物号:CN11-1328/S,国际标准连续出版物号:ISSN0578-1752,邮发代号:2-138,国外代号:BM43。《中国农业科学》英文版(AgriculturalSciencesinChina,ASA),2002年创刊,月刊。2012年更名为《农业科学学报》(JournalofIntegrativeAgriculture,JIA)。2006年1月起与国际著名出版集团Elsevier合作,全文数据在ScienceDirect平台面向世界发行。2009年被SCI收录,2015年JIA影响因子为0.724。2016年获“中国科技期刊国际影响力提升计划”第二期项目B类期刊资助。JIA大16开,每月20日出版,国内外公开发行。每期180页,国内订价80.00元,全年960.00元。国内统一连续出版物号:CN10-1039/S,国际标准连续出版物号:ISSN2095-3119,邮发代号:2-851,国外代号:1591M。《中国农业科学》中、英文版均可通过全国各地邮局订阅,也可向编辑部直接订购。邮编:100081;地址:北京中关村南大街12号《中国农业科学》编辑部电话:010-82109808,82106281,82105098;传真:010-82106247网址:www.ChinaAgriSci.com;E-mail:zgnykx@caas.cn;联系人:林鉴非征订
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