DPABI学习
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简介DPABI：atoolboxforDataProcessing&AnalysisforBrainImaging，evolvedfromDPARSF(DataProcessingAssistantforResting-StatefMRI).安装AddwithsubfoldersforDPABIinMATLAB'spathsettingandenter"dpabi"inthecommandwindowtoenjoythispowerfultoolbox.数据相关概念DICOMdataNIFTIdataTimePointTRMNI…预处理DataProcessingincludes:slicetiming、realign、reorient、crop、skullstrip、normalize、smoothandsoon.RealignWhy?扫描过程中由于被试头动，导致扫描图不在一个位置，需要把图像矫正到同一个位置。Checkheadmotion：HeadMotion.csv用excel打开，每个被试的头动情况。Hmvox_x_*.nii、FDvox_*.nii、Tdvox_*.nii、MeanFDvox.nii、MeanTDvox.nii.Reorient、CropandBetReorient:原点在前联合，对图像进行调整；CropT1：把脖子去掉，对准、分割更好；Bet：亦称Skullstrip，头皮、头骨有很强的信号，把头皮头骨等去掉，再做coregistra-tion，但是SPM中做分割用未去头皮头骨的来做。NuisanceCovariatesRegressionPolynomialtrend:0、1、2、3.Friston24-parameter：6headmotionparameters；6headmotionparametersonetimepointbefore；12correspondingsquareditems.HeadmotionscrubingregressorsNuisanceRegressionWM、CSF、GSMaskbasedonsegmentationorSPMapriori；CompCorormeanGlobalSignalbasedonAutomask.NormalizeWhy?每个被试大脑结构各异，是不可比的；哪个结构有问题，得有个
标准
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空间才能具体到某个位置。Method：DARTEL.SmoothWhy?Reducetheeffectsofbadnormalization;IncreaseSNR.FWHM
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