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噬菌体筛选

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噬菌体筛选噬菌斑分析 1、 将合适的宿主菌接种到M9TB培养基上,37℃摇至0D600=1.0; 2、 使用前,可将宿主菌保存在4℃,保存超过48h的菌不可使用; 3、 熔化足够量的顶层培养基,每个平板需5ml,将熔化后的培养基放在45-55℃的水浴锅中; 4、 使用无菌LB培养基制备一系列稀释度的样品。通常选择103-106的重组噬菌体稀释度。空白对照则选择107; 10-2        10-3                        10-7 10μL样品 100μL      ………… 990μL   ...

噬菌体筛选
噬菌斑分析 1、 将合适的宿主菌接种到M9TB培养基上,37℃摇至0D600=1.0; 2、 使用前,可将宿主菌保存在4℃,保存超过48h的菌不可使用; 3、 熔化足够量的顶层培养基,每个平板需5ml,将熔化后的培养基放在45-55℃的水浴锅中; 4、 使用无菌LB培养基制备一系列稀释度的样品。通常选择103-106的重组噬菌体稀释度。空白对照则选择107; 10-2        10-3                        10-7 10μL样品 100μL      ………… 990μL          900μL 5、 准备4mL的无菌管,加入250μL的宿主菌。从最高稀释度开始加起,每管加入100μL噬菌体稀释液。注意换枪头; 6、 在每管中加入3mL的顶层培养基,混合后倒在无抗LB/LB carb+/LB carb+amp+平板上,轻摇使其迅速铺平; 7、 平板静置几分钟后,翻转,37℃培养3-4h或室温过夜; 8、 数噬菌斑数并计算噬菌体滴度。 如:稀释度为10-6的平板上有200个噬菌斑,则滴度为 200×106×10=2×109pfu/mL 样品中噬菌体总数由滴度×样品总量决定。如:1μg的载体DNA被包装,最终的包装反应体积为0.3mL(25μL包装提取物+5μL连接物+270μL无菌培养基)。在包装反应中pfu总数为2×109pfu/mL×0,3mL=6×108pfu。另外,因为使用了1μg的载体,效率是6×108pfu。 文库扩增 当原始重组体总数少于5×106,选择平板裂解法;当需要大量扩增时,选择液体裂解法。 平板裂解扩增 1、 接种1mL过夜培养的宿主菌到50mL TB培养基,37℃摇至OD600=0.6-1.0,如果使用5615菌,当OD600=0.5时,添加IPTG至终浓度1mM,然后继续摇30min; 2、 如果包装反应保存在氯仿里,轻微离心分离出氯仿,将噬菌体吸出; 3、 计算需要的细胞和噬菌体量。每10mL细胞含1×106,将噬菌体和细胞混合,加入50mL培养基,这些混合物需在20min内倒入平板。 4、 转接1mL的噬菌体/细胞混合物到无菌的15mL管子内; 5、 每个管子内加入10mL熔化的45-55℃的顶层培养基。混匀后直接倒到150mm的无抗LB/LB carb+/LB carb+amp+平板上,轻轻平摇使琼脂糖培养基铺平; 6、 平板静置几分钟,待顶层培养基凝固,翻转,培养至噬菌斑几乎融合(37℃培养3-4h或室温过夜); 7、 每个平板上加入10mL噬菌体提取Buffer(20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 100 mM NaCl, 6 mM MgSO4 ),置于4℃水平面2h-过夜; 8、 平板稍微倾斜,吸取上层液体至无菌管内。将所有提取Buffer集中到一个管子内。加入0.5mL氯仿,轻轻混匀。3000×g,5min,澄清裂解物,将上清吸到无菌管子内。经噬菌斑分析决定扩增文库的滴度。扩增文库的裂解物可在4℃保存滴度不降低。若要长期保存,加入0.1倍体积的80%无菌甘油,-704℃保存。 液体裂解法 1、 从划线的平板上挑取单菌落接种到50mL相应抗性LB培养基中,37℃摇过夜。宿主菌可在4℃保存两天; 2、 将5mL过夜培养物加入500mL无抗LB/LB carb+/LB carb+amp+培养基中,37℃摇至OD600=0.6-1.0,如果使用5615菌,当OD600=0.5时,添加IPTG至终浓度1mM,然后继续摇30min;培养物种细胞数计算公式: 3、 在MOI为0.001-0.01时,用噬菌体感染培养物(每个pfu1,00-1000个细胞)。比如,500mL宿主菌培养物OD600=0.75,则细胞总数为: 这一培养物可被1.5 × 108到1.5 × 109pfu感染。 4、37℃摇1-3h至可观察到裂解。裂解会使OD值下降,培养集中细长残片会增加。一旦观察到裂解就停止培养,过分培养会导致滴度降低; 5、8000g,10min澄清裂解物。将上清吸到无菌管子内。经噬菌斑分析决定扩增文库的滴度。 6、扩增文库的裂解物可在4℃保存滴度不降低。若要长期保存,加入0.1倍体积的80%无菌甘油,-70℃保存。 文库筛选 目标蛋白包被ELISA板 1、 用去离子水洗板子数次,轻拍去除水分; 2、 稀释目标蛋白至1-10μg/mL; 3、 每孔加100μL稀释蛋白,室温3-4h或4℃过夜; 4、 每孔用300μL 1×TBS或水洗3次,洗去未结合的蛋白; 5、 准备5%的阻断剂(用水稀释),每孔加200μL; 6、 室温孵育60min或4℃过夜; 7、 去离子水洗板子5次,每孔加200μL水。盖住板子保存在4℃,待用。板子可保存数周。 筛选 1、 接种相应的宿主菌至抗性LB培养基中,37℃摇至0D600=0.5-0.6; 2、 根据扩增文库的滴度和期望筛到噬菌体数,计算第一轮筛选所需的噬菌体裂解物的量。比如,一个多肽文库包含1×109原始重组体,期望筛库100次,扩增文库的滴度为3×1011pfu/mL,则第一轮所需裂解物的量计算如下 3、 配制100mL的1×TBST(10mL 10×TBST + 90mL 去离子水); 4、 每孔加100μL噬菌体裂解物, 室温孵育30min; 5、 用1×TBS洗板子5次。也可用真空洗板机或每孔加入多于200μL的Buffer,短暂孵育,倒出buffer,拍干; 6、 加入200μL T7抽提液,抽提结合的噬菌体,室温孵育10-20min; 7、 将噬菌体抽提液收集在15mL无菌管中; 8、 将250μL抽屉的噬菌体添加到50mL宿主菌培养液中(第一步中制备的),37℃摇至裂解(1-3h); 9、 将裂解培养物收集在50mL离心管中,8000g,10min。收集上清,4℃保存备用(下次筛库用)。
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分类:医药卫生
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