单位及实验室名称
项 目
编号:
日期:
版本:
丙型肝炎病毒核酸HCV-RNA扩增荧光定量检测标准操作程序
1.目的:明确丙肝病毒核酸定量检测的操作
规程
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,指导检验人员正确进行丙肝病毒核酸定量的检测。
2.适用范围:
2.1适用于进行丙肝病毒核酸定量检测的检验人员。
2.2适合仪器:LightCycler480型核酸扩增荧光检测仪
2.3方法原理:采用PCR方法结合荧光探针的扩增技术
2.4样品要求:血清
3.
职责
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:实验操作人员应严格按操作规程进行实验。
4.试剂来源:深圳凯杰公司HCV RNA荧光PCR检测试剂盒。
5.质控物:阴性、阳性对照及阳性参控品系列均来源于试剂盒
6.标准操作:
6.1 试剂准备(在试剂准备区操作)
6.1.1将试剂盒及其它所需试剂置室温解冻,完全融解后混匀。
6.1.2根据当次实验标本量,取出相应试剂(1管=28ul反应液+2ul Enzyme Mix)总的需求量于一管中(其余随即放回原温度保存),如所需要的管数为n (n=标本数+1管阴性对照+1管阳性对照+1管临界阳性对照+4管阳性参控品)(定性检测无需做阳性参控品), 取PCR反应管转移至样本制备区。
6.2.实验前准备步骤:
6.2.1所需试剂置室温平衡,裂解液和洗液1如出絮状沉淀,37℃温浴至沉淀完全消失。
6.2.2在洗液1中加入16ml无水乙醇,做好标记,室温保存,使用前摇匀。
6.2.3在洗液2中加入23ml无水乙醇,做好标记,室温保存,使用前摇匀。
6.2.4将310ul的洗脱液加入含有310ug的Carrier RNA中,充分混匀,分装,-20℃储存.不要反复冻融3次.
6.2.5裂解液工作液的制备
混合后2-8℃稳定保存48小时,裂解液工作液必须每次实验前新鲜配制
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裂解液工作液制备
表
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人份数
裂解液用量(ml)
Carrier RNA混合液用量(ul)
HCV内对照用量(ul)
人份数
裂解液用量(ml)
Carrier RNA混合液用量(ul)
HCV内对照用量(ul)
1
0.22
6.2
6.6
13
2.86
80.1
85.8
2
0.44
12.3
13.2
14
3.08
86.3
92.4
3
0.66
18.5
19.8
15
3.30
92.4
99
4
0.88
24.6
26.4
16
3.52
98.6
105.6
5
1.10
30.8
33
17
3.74
104.7
112.2
6
1.32
37.0
39.6
18
3.96
110.9
118.8
7
1.54
43.1
46.2
19
4.18
117.0
125.4
8
1.76
49.3
52.8
20
4.40
123.2
132
9
1.98
55.4
59.4
21
4.62
129.4
138.6
10
2.20
61.6
66
22
4.84
135.5
145.2
11
2.42
67.8
72.6
23
5.06
141.7
151.8
12
2.64
73.9
79.2
24
5.28
147.8
158.4
6.2.6将1.4ml蛋白酶溶解液加入蛋白酶冻干粉试剂瓶中,混匀至完全溶解,避免有泡沫,2-8℃保存.
6.3样本制备及加样(在标本制备区操作)
6.2.1取n个1.5ml的灭菌离心管(n=样本数 + 1管阴性对照+1管强阳性对照+ 1管临界阳性对照),做好标记。
6.2.2分别加入25ul蛋白酶溶液.
6.2.3分别加入待测样本,阴性对照,强阳性对照,临界阳性对照各200ul
6.2.4加200ul新鲜配制的裂解液工作液盖上盖子,振荡15秒,混匀(不可把蛋白酶溶液加入到裂解液中 ).
6.2.5 56℃温浴15min,瞬时离心,去除盖上液滴.
6.2.6加入250ul无水乙醇,盖上盖子,振荡15s,室温静置5min. ,瞬时离心,去除盖上液滴.(室温超过25℃,无水乙醇要预冷.)
6.2.7将n个纯化柱放入收集管中,将6.2.7的液体移入到纯化柱中,盖上盖子,6000g离心1min,倒掉废液.
6.2.8打开纯化柱的盖子,加入500ul洗液1, 6000g离心1min,倒掉废液.
6.2.9打开纯化柱的盖子,加入500ul洗液2, 6000g离心1min,倒掉废液.
6.2.10打开纯化柱的盖子,加入500ul无水乙醇, 6000g离心1min,倒掉废液.将纯化柱放入新的收集管中.
6.2.11 20000g高速离心3min,除去乙醇.
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6.2.12将纯化柱放入干净的1.5ml离心管中,开盖,56℃温浴3min,以除去残留液体.
6.2.13将纯化柱放入另一个干净1.5ml离心管中,加入60ul洗脱液(加到膜中央).盖上盖子,室温静置5min.20000g离心1min收集滤出液.4℃保存备用.应在2h内用于PCR扩增,或-70℃保存一个月
6.2.14取20ul的6.2.13的RNA溶液及定量标准品,加入PCR反应管中.
6.3 PCR扩增(在扩增区操作)
6.3.1打开稳压器电源,再打开计算机电源。
6.3.2 打开扩增仪电源,按仪器操作规程进入扩增循环条件设定。
6.3.3将循环条件设定为
循环条件设置:
50°C:30 分钟;95°C:15 分钟;
95°C:15 秒, 50°C:45秒, 72°C:15秒;荧光信号收集设在50°C。
45 个循环。反应体系为50 μ
6.3.4仪器检测通道选择
Roche LC480(96 well):选择FAM检测通道;HBV内对照(IC)选择VIC检测通道。在50℃时荧光信号收集方式设为“SINGLE”。
6.3.5检查反应管是否盖紧,以免荧光物质泄漏污染仪器。
6.3.6将待反应的PCR反应管放入扩增仪中,并根据实际情况和仪器操作规程在程序中设定好样孔位置。
6.3.7按仪器操作规程开始循环。
6.3.8扩增结束后取出PCR反应管,关闭扩增仪电源,反应管直接放入焚烧垃圾桶内。
6.3.9分析数据,在Analysis Notes窗口中注明检测基线值、试剂批号、阳参批号等相关信息,进行结果分析。
6.3.10关闭计算机。
6.4 结果判断:
6.4.1 1个阴性对照的值应0IU/ml,1个强阳性对照的值在5×105-1.0×107IU/ml,1个临界阳性对照的值在1×103-1.0×105IU/ml.
6.4.2 HCV阴性对照,临界阳性对照的内对照Ct≤33,否则视为无效。
6.4.3 4个阳性参控品的基因拷贝浓度的对数值为横坐标,以其实际测得的Ct值为纵坐标,作标准曲线,标准曲线的拟合度R应大于等于0.98,否则应视为
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实验无效。
定量结果分析:上述两项质控标准均满足时,可对样品进行定量分析。分析数据时,根据标准曲线自动计算未知标本的相应基因拷贝浓度。若发现有标本Ct值小于15,须将其剔除此次结果分析,该标本稀释后再测直至其Ct值大于15。
6.5
报告
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6.5.1 定量结果判断
检测样本中HCV-RNA≥1×103IU/ml(copies/ml)且≤5×107IU/ml时,按实际检测结果报告;检测样本中HCV-RNA<1×103IU/ml(copies/ml)时,均报告“≤1×103IU/ml”。 检测样本中HCV-RNA>5×107IU/ml(copies/ml)时,均报告>5×107IU/ml”。
6.5.2报告的签发依据检测结果报告程序。
7.支持性文件:
7.1 《丙型肝炎病毒核酸扩增荧光检测试剂盒》说明书(深圳凯杰股份有限公司)
7.2 检测结果报告程序。
7.3 LightCycler480型核酸扩增荧光检测仪说明书
8.此标准操作变更程序:如果本操作程序使用者在实际工作中发现其存在问题,则应向科室负责人提出,科室负责人则召集所有与本程序有关的人员讨论,以决定是否需要变更本程序。