(Excellenthandouttrainingtemplate)BioRad数字微滴PCR一、ddPCR是什么二、ddPCR的发展三、ddPCR的操作
流程
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四、ddPCR的应用一、ddPCR是什么ddPCR是一种新形的绝对定量PCR,其特点是灵敏度高、定量精确、
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的线性范围宽、特异性好、费用适中,是一种很有前途的分子定量检测手段。微滴数字PCR的原理,就是把原来一整管的PCR反应液,分散成几万个,甚至几百万个极微小的液滴。这些小微滴同时进行PCR反应,这样就可以计算出原来的反应液当中,有多少个目标基因的拷贝了。二、ddPCR的发展1999已经以数字PCR为名字发
表
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了文章,2011年底数字PCR进入一个商业化的,一些公司也是这个时候的产生。2012年的一片Nature综述提到了数字PCR可以为科研临床带来的变化和提供的一些服务。普通的PCR荧光定量PCRddPCR1、定量方式是一种绝对的定量方式;2、对PCR的扩增效率以及他对PCR抑制剂的要求都比第二代的PCR要低;3、不需要任何的
标准
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品;4、在实验结果方面,在精确度、灵敏度和重复性一个本质的提升。三、ddPCR操作流程四、ddPCR的应用1、基因表达量检测;2、肿瘤的检查(肿瘤的突变序列,肿瘤的拷贝数突变的检查;3、二代测序的定量和二代测序的QC;1、基因表达检查基因表达检测,现在用的最广的是荧光定量PCR。但是存在许多弊端:首先制作一个标准曲线,其次是要拿到各个样品,包括对照组、样品组所有基因的CT值。在低拷贝的情况下我们要做多板分析时,我们要做板间比较还要做一些板间的质控,来矫正掉不同板与板的技术误差。而ddPCR可以避免这些缺点。2、肿瘤的检查(肿瘤的突变序列,肿瘤的拷贝数突变的检查;3、二代测序的定量和二代测序的QC;1)Illumina平台2)IonTorrent平台谢谢!