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中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2010,30(8):118125
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综 述
amiRNAi实现高效稳定的特异基因沉默新方法
叶梅霞 刘军梅 李 昊 崔东清 王静澄 张志毅 安新民
(北京林业大学林木育种国家工程实验室 林木花卉遗传育种教育部重点实验室
国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室 北京 100083)
摘要 RNA干扰技术(RNAinterference,RNAi)是实现基因沉默的有效工具。近年来,随着分子
生物学与生物技术的快速发展,在 RNAi基础上又发展出另一种特异性更高的基因沉默技术—
amiRNAi(artificialmicroRNAinterference)。amiRNAs是一类由内源 miRNA前体生成的长21个
核苷酸的人工小RNA分子,它能在不影响其他基因
表
关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf
达的情况下特异地介导单个或多个靶基因
高效稳定沉默。与普通的RNAi相比,amiRNAi具有特异性高、稳定性强和沉默效应可预见等优
点。因而amiRNAi可能成为基因功能
分析
定性数据统计分析pdf销售业绩分析模板建筑结构震害分析销售进度分析表京东商城竞争战略分析
的最有效工具之一,同时 amiRNAi对于基因负调控研
究和应用而言前景广阔。着重介绍了amiRNAi技术的原理、优势及其潜在的应用价值。
关键词 amiRNAi miRNA siRNA 基因沉默
中图分类号 Q756
收稿日期:20100323 修回日期:20100512
国家“863”计划(2009AA10Z107)、教育部重点项目(108017)、国
家林业局项目(2006472,LY0902)资助项目
通讯作者,电子信箱:xinminan@163.com
在过去10年中,RNAi已被广泛应用于基因敲除
的研究[1],其作用机制是由互补的内源或外源 RNA形
成的双链RNA诱发基因沉默。双链 RNA经 RNaseIII
中Dicer或Dicerlike(DCL)酶加工后形成长2026nt的
小RNA(smallRNA,sRNA)。随后这些小 RNA可直接
作用于Argonaute(AGO)蛋白,构成RNA诱导的沉默复
合体(RNAinducedsilencingcomplex,RISC)效应物中
的核心成分。RISC以 sRNA为导向,根据序列互补原
则作用于靶 mRNA上,从而导致靶 mRNA的断裂或翻
译抑制[2]。由转基因导致产生的反义 RNA、反向重复
RNA或病毒RNA虽然已经成功应用于各生物体内源
基因的表达敲除,但是通过这些途径实现的基因沉默
存在着脱靶效应、沉默效率多变以及稳定性较差的问
题
快递公司问题件快递公司问题件货款处理关于圆的周长面积重点题型关于解方程组的题及答案关于南海问题
[34]。amiRNA首先在人类细胞研究中得到了应
用[5],随后又报道了在拟南芥中 amiRNA的应用[6]。
2006年以来,陆续发表了利用内源miRNA自然前体人
工合成具有理想序列的 miRNA,并以此下调特定基因
表达的相关报道。而且认为在组成型、组织特异型或
诱导型启动子驱动下的 amiRNA都能有效表达。
amiRNA这种严格的时间上和空间上的表达被称为自
控效应(autonomouseffects)。已有研究表明,组织特异
型启动子驱动 amiRNA的非自控效应(nonautonomous
effects)即使存在,也极为有限[7]。无论内源基因还是
外源基因,都已证明amiRNA能使其高效沉默。这种通
过amiRNA实现可预见的特异基因高效稳定沉默是
RNAi发展进程中的又一重大突破,已经成为反向遗传
学研究的有力工具。
1 amiRNAi与siRNAi
作为非编码RNA家族成员之一的sRNA是一类长
20~24个核苷酸的调控性小分子RNA(包括miRNA与
siRNA),它们可通过剪切 mRNA或抑制蛋白
翻译
阿房宫赋翻译下载德汉翻译pdf阿房宫赋翻译下载阿房宫赋翻译下载翻译理论.doc
的方
式负向调控靶基因的表达,从而导致基因沉默。在植
物中miRNA和 siRNA都由 DCL酶作用于其前体加工
形成的。前者的前体是位于发夹状茎环结构茎部的一
段序列[8],后者则来源于双链 RNA(doublestranded
2010,30(8) 叶梅霞 等:amiRNAi实现高效稳定的特异基因沉默新方法
RNA,dsRNA)[9],但两者有着相同的生化活性。在保
持发夹状miRNA茎环前体的结构和能量特征不变的条
件下改变碱基,也可产生与自然miRNA具有相同长度、
但与自然 miRNA序列完全无关的小 RNA[56,10],这种
小RNA分子就是 amiRNA。amiRNA双体与 siRNA双
体及miRNA双体类似,AGO蛋白优先与 amiRNA双体
中5′端不稳定的一条链结合形成RISC复合体,这条链
通过碱基互补配对的方式作用于靶 mRNA。amiRNA
沿用了miRNA选择靶标时的各项参数标准[11],它的显
著特点就是在其3′端引入了1~2个错配[12],从而提高
了对靶标选择的特异性,它能在不影响其他转录本表
达的情况下特异性地沉默靶序列。但由反义 RNA、病
毒RNA、发夹式 RNA(hairpinRNA,hpRNA)所产生的
siRNA却不具备这个特点。
1.1 反义RNA诱导的基因沉默
反义 RNA介导的基因沉默是指将与特定 mRNA
互补的反向序列片段导入生物体内使目的基因沉默的
方法。Izant等[13]证明了动物细胞内反义 RNA对其互
补的mRNA链的表达具有抑制作用。强启动子或外源
基因的表达以及在载体上呈反式排列的同源 DNA都
是形成反义 RNA的重要原因[14]。迄今转基因与其
!
源基因的沉默现象由sRNA介导已为我们所知,产生这
种sRNA的dsRNA既可来自于反义 RNA和与之互补
的mRNA链所形成的复合体,也可由作用于反义 RNA
链的 RNA依赖的 RNA聚合酶 (RNAdependentRNA
polymerase,RdRp)合成[15]。
1.2 病毒诱导的基因沉默
目前已被广泛应用于植物基因功能研究的另一种
方法就是病毒诱导的基因沉默(virusinducedgene
silencing,VIGS)。这种方法主要是将病毒RNA中负责
编码 RdRp酶的基因连接到表达载体的启动子之
后[16]。含有植物目的序列的病毒基因组侵染时大量复
制,期间在RdRp的作用下可合成 dsRNA,dsRNA也可
由病毒单链RNA折叠形成。当 DCL作用于 dsRNA时
可得到能导致内源基因高效沉默的siRNA。VIGS是一
种瞬时表达体系,它不需要产生能够稳定表达沉默结
构的转化株后代[17],因而它不能稳定遗传。病毒对植
株一般都具有最佳的侵染时期,所以对于在最佳侵染
时期内不表达的基因来说,用该方法来研究其基因功
能就有局限性[18]。
1.3 hpRNA介导的基因沉默
另一种比单独引入正义或反义转基因片段更容易
实现基因表达抑制的途径—hpRNA介导的高效基因沉
默途径,又被称为反向重复转录后基因沉默(post
transcriptionalgenesilencing,PTGS)或 发 夹 RNAi
(hairpinRNAi,hpRNAi)[1920]。hpRNA载体在构建时
引入了既彼此接近又被内含子隔开的反向重复片段,
转录时可形成茎部为 dsRNA结构的发夹茎环结构。
dsRNA经DCL酶作用后能产生多个 siRNA。Khraiwesh
等[21]将这一方法用于小立碗藓(Physcomitrellapatens)
时,发现该途径介导的基因沉默并不稳定。另外,Dicer
酶对mRNA的作用位点与 siRNA的5′端并非已知,因
此就难以预计出hpRNA的靶mRNA。
1.4 转录水平的基因沉默
siRNA或miRNA与mRNA相互识别并配对的结果
是转录后基因沉默。当它与 DNA结合时,由于 siRNA
是一些甲基化转移酶活化的起始信号,甲基化转移酶
在siRNA的作用下可使 DNA发生甲基化。DNA甲基
化主要发生在目的基因5′端的启动子区域[22],阻碍转
录因子与启动子的互作,进而影响 DNA正常转录,最
终导致转录水平的基因沉默发生(transcriptionalgene
silencing,TGS)。这种通过启动子甲基化来获得基因沉
默的方式在植物中并不常见,因为 siRNAs要求转录的
mRNA作为
模板
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与其配对,而不是基因组 DNA,只有基
因外区域(extragenicregions)被偶然转录时才允许发生
转录水平的基因沉默即DNA甲基化或染色质修饰[12]。
2 amiRNAi的原理
植物中既没有自然的 amiRNA,也不能自然产生
amiRNA,它是由内源 miRNA前体加工形成、长为21nt
的单链 RNA。为达到特异沉默预定靶基因的目的,
amiRNA需要根据自然miRNA选择靶基因时的参数来
设计。10~11位是断裂位点,不允许错配;2~12位只
能有一个错配,该区域与靶mRNA的配对至关重要;13
位后的区域不允许有连续错配[11];至少要有完全配对
时自由能的70%,而且绝对杂交能量范围介于35~
38kcal/mol之间,最高不能超过30kcal/mol[11];3′端和
5′端同时存在错配,会影响 miRNA靶向瞄准 mRNA。
另外为了使amiRNA与自然miRNA相像,amiRNA还必
须达到三条标准(wmd3.weigelworld.org):(1)5′端相
对amiRNA不稳定,即5′端的AU含量与第19位碱基
左右的3′端GC含量都高于 amiRNA,以便于 RISC复
合体与之结合[2324];(2)第1位核苷酸碱基为 U,第10
位为A,因为有50.9%的自然miRNA中第1位与10位
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碱基分别为 U与 A[2526]。(3)为防止传递效应
(transitivity)的产生,即防止沉默作用范围扩大,
amiRNA还必须在 3′端的 18~21位引入 1~2个错
配[7]。用于设计 amiRNA分子的 WMD软件正是在此
基础上开发出来的。此外前体 miRNA区还必须经过
适当的修饰,使最终的 amiRNAamiRNA 双体与
miRNAmiRNA双体的结构特征与能量特征都能保持
不变[7]。
2.1 amiRNA分子设计及其克隆
2009年6月 Weigel等在 wmd3.weigelworld.org上
发布了 WebmicroRNAdesigner3(WMD3)以优化
amiRNA的自动设计。该软件可利用已公布的转录本
和EST数据库,分别为未作注释的转录本、外源基因以
及特异剪接形式的mRNA设计amiRNA;通过与数据库
中转录本序列进行比对,可识别出允许的非预期靶基
因。WMD3在杂交能量计算与 amiRNA结果排序等方
面作了改进。
WMD3可根据最终选定的 amiRNA自动设计出4
条合适的引物序列。利用这 4条引物可人工合成
amiRNA,进而导入受体中表达,使amiRNAamiRNA代
替miRNAmiRNA。克隆过程需有含 miRNA前体的
载体,目前WMD3中有pRS300,pNW55,pChlamiRNA2,
pChlamiRNA3等载体。现以pRS300为例说明 amiRNA
的分子克隆原理。该质粒含有拟南芥 miR319a前体,
可作为PCR模板。amiRNA前体可通过重叠延伸 PCR
合成(图1)。第一轮 PCR首先扩增出引物 AIV,II
III,IB的产物a、b、c片段,随后第二轮PCR以A、B为
引物,以 a、b、c3个片段为模板,合成覆盖整个前体的
片段d,其中引物A、B由模板质粒序列设计而来,序列
分别为:“CTGCAAGGCGATTAAGTTGG
GTAAC”,“GCGGATAACAATTTCACACAGGAAACA
G”[27]。引物A、B均结合于 pBSK多克隆位点以外的
区域,以利于合成较大的PCR产物。pBSK中的多克隆
位点可用来酶切释放amiRNA前体,常用的是前体5′端
的EcoRⅠ和3′端的BamHⅠ。将修饰后的 amiRNA前
体构建到植物表达载体中,转化植物使之超量表达。
2.2 amiRNA的分子作用机制
含有目的基因amiRNA前体的载体导入植物体后,
amiRNA区段序列与 amiRNA区段序列以及中间一段
间隔序列自动折叠形成发夹状的二级结构,这与反向
重复RNA形成hpRNA的过程十分类似。该二级结构
的茎部包含由 amiRNA序列与 amiRNA序列形成的
图1 amiRNA工程[7]
miRNA双体(蓝色部分)到 amiRNA双体(红色部分)的转变可
由片段a、b、c通过重叠延伸PCR实现。(a)、(b)、(c)分别是引
物AIV,IIIII,IB作用于miRNA前体模板的产物。转变过程
中,amiRNA保持了miRNA的结构特征与能量特征
Fig.1 EngineeringofamiRNAs
Theexpected21nucleotideamiRNAduplex(red)wassynthesized
throughtheoverlappingPCR ontheprecursorsofendogenous
miRNAs(blue).Thetransitionwasachievedbya,b,cfragmentin
asinglereactionwithprimersAandB.Bothstructuralandenergetic
featuresofmiRNA precursorwere retained. a, b, c are
correspondingproductsofprimerAIV,IIIII,IB
dsRNA。
新形成的amiRNA双体部分在结构上继承了原有
miRNA双体中错配凸起的典型特征。不论凸起结构的
数量还是凸起结构在前体中的相对位置,两者都是相
同的,这种结构的相似性与能量的稳定性为 DCL酶准
确加工 amiRNA前体创造了有利条件[28]。因此,
amiRNA前体经DCL酶剪切产生的 amiRNA双体中的
amiRNA序列就正是具有目的设计特征的 amiRNA
(图2)。
与普通小 RNA的选择原理相似的是,amiRNA双
体也倾向于将其中5′端不稳定的一条链导入 AGO蛋
白中,并形成RISC复合体的核心组件[7]。该复合体中
amiRNA起引导作用,它能根据序列碱基互补原理,将
整个RISC复合体带到靶mRNA上,从而导致靶 mRNA
的断裂或翻译抑制。对于多个靶基因来说,它们在序
列上可以完全一致,也可以有略微差异[12]。根据上述
amiRNA分子设计时的各项错配参数可知,错配也可出
现不同的位置组合。在 amiRNA对靶基因表达的负调
控中,抑制mRNA的翻译只起次要作用[7],mRNA断裂
引起的转录本降解是多数植物 miRNA或 siRNA的主
要作用方式,这一特点与自然小 RNA一样。靶 mRNA
在距离amiRNA的5′端10~11个碱基处发生断裂。在
amiRNA过表达植株中,多数靶基因的转录本都大幅下
调,并引起靶基因沉默的表型变化。目前还没有开发
出利用多个amiRNA使同一靶基因沉默的技术,它将进
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图2 amiRNA的分子作用机制示意图
(引自http://wmd3.weigelworld.org/cgibin/
webapp.cgi,并略作修改)
amiRNA表达盒中,发夹状茎环结构的 amiRNA前体转录后,在
DCL酶的作用下形成 amiRNA双体,随后 amiRNA双体结合到
RISC复合体中,最终引发目标mRNA的断裂
Fig.2 Theschematicdiagramofmolecular
mechanismofactionforamiRNA
amiRNAprecursorwithahairpinstemloopstructureexpressedfrom
theamiRNAcassettewereprocessedbyDCLenzymetotheamiRNA
duplex,whichwassubsequentlyincorporatedtotheRISC,triggering
thecleavageofthemRNA
一步提高amiRNA的沉默效率。由于完全互补或只有
部分互补的 siRNA都能作用于目标 mRNA,最终导致
mRNA的断裂,所以多个 siRNA同时沉默同一靶基因
的情况对siRNA来说却是非常普遍[7]。
2.3 amiRNA的沉默效率
大量研究表明,amiRNA靶基因的转录水平与
amiRNA水平呈明显的负相关关系,amiRNA过表达能
引起大多数靶基因转录水平的大幅下调,并出现相应
的表型变异,但各表型的变化程度不一致。同一
amiRNA的不同靶mRNA都可被成功下调,但下调程度
也不尽相同。mRNA在空间位阻较大以及二级结构较
紧密的条件下难以与amiRNA结合,这是导致沉默效率
差异的重要原因;另一种可能的原因就是靶基因受到
了强烈的负反馈调节[7],无论amiRNA的数量和效率多
高,靶基因的转录水平都不会大幅下降。Khraiwesh
等[21]提出自然miRNA与amiRNA两者在与RISC复合
体结合时可能存在竞争关系,因而造成不同amiRNA对
各个靶基因的调控程度不一。amiRNA常以数量方式
介导基因沉默,强启动子通常能诱导更高效的基因沉
默[7,29]。如用ML1启动子与35S启动子时靶基因的下
调程度有明显差异[7]。Warthmann等[30]对水稻三个基
因(Spl11,Pds,Eui1)分别采用了两种 amiRNA载体,结
果发现同一基因的两种 amiRNA载体沉默效率也存在
显著差别。目前 amiRNA高效表达载体的构建是
amiRNA技术应用领域研究的热点之一[28,3132]。
3 amiRNAi技术的优势
3.1 沉默效应的可预见性
siRNA由Dicer酶切割长链 dsRNA产生,但 Dicer
酶在长链dsRNA上的作用位点并不为人所知,而且作
为siRNA前体的长链dsRNA可被 Dicer切成多个具有
不同序列的 siRNA。这样 siRNA就能作用于不同的
mRNA,从而使siRNA介导的沉默效应变得难以预测。
amiRNA双体序列与 miRNA双体序列虽然相差甚远,
但两者在结构与能量上却有共性。所以DCL酶对前体
的剪切位点能保持不变,与 siRNA前体相比,amiRNA
前体就具备了只产生一个 amiRNA的优势[33]。
amiRNA与miRNA一样,只作用于特定的靶转录本,当
amiRNA负调控多基因表达时,其沉默效应的可预见性
得到了充分体现。拟南芥 amiRNA不论是介导单个靶
基因的沉默还是介导多个靶基因沉默,其成功率可达
到75%[12]。ARF(auxinresponsefactors)基因除了促进
花发育、维管发育、细胞生长之外,还可促进植物的侧
生器官分化为远轴组织。Alvarez等用 amiRNAARF沉
默拟南芥、烟草、番茄这三种植物的 ARF2、ARF3、ARF4
基因,结果发现所有这些植物中都有出现近轴组织变
为远轴组织的现象[29]。Qu等对黄瓜花叶病毒
(cucumbermosaicvirus,CMV)的沉默设计了阻遏2b基
因的amiRNA,并以hpRNA途径与之比较抗病效果,结
果发现amiRNA对 CMV病毒的抵御能力是 hpRNA的
两倍[34]。因此 amiRNAi技术可在不影响其他基因表
达的条件下,为基因功能的研究开辟一条便捷高效的
新途径。
3.2 amiRNA作用的非传递性
siRNA不仅可以诱发靶转录本的断裂,还有充当
RdRp引物的可能。mRNA断裂产物中也有一些可充
当RdRp的引物,进而参与二级 siRNA的形成[35],而不
是被降解。其原因是siRNA能与靶转录本实现完全互
补[7],这样,部分dsRNA就可在该引物的作用下延伸形
成更长的dsRNA,然后由Dicer酶再次加工形成更多的
siRNA,并参与到沉默各个不同靶基因的过程中[36]。
沉默作用范围扩大的过程被称为传递(transitivity),或
者二级RNAi效应。
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amiRNA设计时在18~21位引入的1~2个碱基
错配[12],能大幅度减少amiRNA充当RdRp酶引物的可
能性。因此,amiRNAi不会引起二级siRNA的产生[37],
不会扩大沉默作用范围。此外,amiRNA在引发预期靶
mRNA沉默的同时,也不会影响其他基因的正常表达。
3.3 amiRNAi的细胞自控效应
siRNA具有强大的细胞穿透能力,它可通过植物大
分子运输系统进行系统扩散传递[38],这种穿透不同类
型组织和细胞的现象就是系统性的 RNA干扰。比如
病毒 siRNA可在远端引起整个植株的沉默,即使最初
只在局部接种病毒[36,39]。因而利用siRNA介导的基因
沉默途径来鉴定空间特异性表达的基因功能会产生适
得其反的结果。
amiRNA和自然 miRNA一样[7],与 siRNA存在以
下两方面的差异,这两方面构成了amiRNA的细胞自控
效应(cellautonomouseffect)。首先,amiRNA能在诱导
型启动子驱动下表达,表现出时间特异性,即基因表达
的瞬时敲除。Schwab等采用乙醇响应诱导表达系统,
用乙醇处理转入 amiRwhite1(抑制叶绿素的合成)和
amiRtrichome(抑制表皮毛的形成)的拟南芥幼苗,3
天内表现出了预期表型。撤除乙醇后5天,幼苗新生
幼嫩部位又重新分别恢复成绿色和密被柔毛[7]。其
次,在组织特异型启动子控制下,amiRNA的沉默效应
仅仅局限于特异组织内。同样在 Schwab的实验中,
AP1:amiRwhite1株系仅出现花色变浅的表型变异。
amiRNA的细胞自控效应有时也存在不完全的情况,但
这种效应甚是微弱[7]。GUN4基因可作为叶绿素合成
的一个辅助因子,当以该基因为靶标的amiRwhite1在
表皮特异型启动子 ML1驱动下表达时,拟南芥幼苗同
样也出现了黄化现象。由于叶绿体只分布于表皮下叶
肉细胞中,由此可推断出amiRwhite1能至少跨越一层
细胞。实验中还出现了叶缘部分颜色淡于叶中部的现
象。由于叶缘的细胞层数少于叶片的其他部位,因此
这也支持了amiRNA的非自控效应只可小范围移动的
结论。
3.4 amiRNA过表达的遗传稳定性
转基因的目的是使外源基因能够在受体植物中世
代稳定遗传并改良某些性状,但转基因植物中有时也
可能存在外源转基因沉默的现象[40],转入 dsRNA的植
物中就有这种情况。转入dsRNA后会导致内源基因的
沉默和功能丧失[41],amiRNAi能避免此现象的发生。
生物体内的miRNA及其前体一般不参与转录沉默[33],
所以受体植株在转入 amiRNA前体之后,amiRNA前体
不会发生自行沉默,其子代能产生相同的 amiRNA。
Molnar等为了探究 amiRNA是否能够避免靶基因的功
能丧失,测定了第500代衣藻 pChlamiRNA2转化株中
DCL1基因沉默的稳定性,结果表明各转化株都保持了
高水平产生amiRNA的能力,也就是 amiRNA的过表达
能被稳定遗传。对小立碗藓的PpFtsZ21amiRNA株系
进行继代培养表明,一年后仍然没有一株恢复PpFtsZ2
1基因的野生型性状[21]。
4 amiRNAi技术的潜在应用
4.1 amiRNAi在基因家族研究中的应用
amiRNA能沉默多个靶基因已被多项研究证
明[7,29,42]。基因组进化过程中某些基因能通过复制形
成双拷贝或多拷贝,要实现这些基因同时沉默,amiRNA
技术的优势就显得尤为突出。许多功能相关的基因常
成套组合,如相互靠近的串联重复基因,它们会对遗传
筛选造成限制。基因家族中各成员由于具有功能相似
性,其他成员可弥补被敲除基因的功能,因而利用以往
的基因敲除技术来确定基因家族中特异基因的功能会
受到其他成员功能的干扰。amiRNA设计时由于充分
考虑到了多种错配,amiRNA与各靶基因之间的互补
位点并不一定要完全相同[12],比如基因家族中各成员
与同一amiRNA间的互补位点就并不完全一致,所以
amiRNA不仅允许序列上完全一致的靶基因同时沉默,
而且还能使靶序列上存在少数几个碱基差异的靶基因
同时沉默,解决基因家族的冗余问题。
4.2 amiRNAi在可变剪接研究中的应用
基因表达往往伴随着 RNA的剪接过程,可变剪接
是调节基因表达和产生蛋白质多样性的重要机制,目
前人们对其调节机制还知之不多。拟南芥中约有10%
的基因具有多种剪接形式[43],由于靶 mRNA对
amiRNA的识别元件很短,所以 amiRNA可用于沉默特
异剪接形式的靶基因。amiRNA分子不具有传递性
(transitivity),因此就不会发生二级 sRNA作用于多种
不同mRNA剪接异构体的情况,导致特异 mRNA剪接
形式的选择性沉默失败。
4.3 amiRNAi在反义RNA功能研究中的应用
DNA双链变性分开后,一条链转录成作为翻译蛋
白的模板即正义 RNA,另一条链尽管不携带编码蛋白
的信息,但也能产生反义RNA与正义RNA互补。以往
普遍认为反义 RNA没有利用价值,但现在发现它能阻
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断其正义RNA的表达,而且证实这种阻断不是 RNAi。
自然形成的反义转录本对相应的有义链可起重要调节
因子的作用,虽然目前尚无沉默反义转录本的技术,但
由于 amiRNA对靶标具有特异性[12],可以实现特异沉
默反义 RNA或正义 RNA,有利于分析正义 RNA与反
义RNA间的相互作用。
4.4 amiRNAi在植物抗病中的应用
RNAi不仅可以作用于植物的
!
源基因,也可以使
外源的同源基因发生沉默。以往都是采用发夹式
RNAi来抵御病毒的侵扰。这种抗病策略而今可以被
amiRNA所取代,可根据病毒致病基因或病毒抑制蛋白
基因设计出 amiRNA转入植物,并诱发对病毒 RNA的
降解[34,44]。芜菁黄花叶病毒(turnipyellowmosaicvirus
,TYMV)的 P69和芜菁花叶病毒(turnipmosaicvirus,
TuMV)的HCPro是两个有名的基因沉默抑制子。有
研究者以P69和HCPro的病毒mRNA序列为靶标,利
用拟南芥 miR159前体设计出了相应的 amiRNA,并通
过amiRNA的表达使其转化植株获得了抵御 TYMV和
TuMV病毒感染的能力[34,44]。
5 展 望
随着越来越多的物种基因组测序工作的相继完
成,后基因组时代已经来临,探索基因功能、明确各基
因间的相互作用及其生物学机制已经成为生命科学研
究的焦点之一。以往鉴定基因功能所采用的基因敲除
技术,通常是以破坏基因结构或抑制基因表达的方式
来实现的,这种方式的鉴定速度远不及人们期望的那
么快。amiRNAi技术的问世为开展相关工作提供了极
大的便利,它能高效特异地抑制目的基因的表达,加快
基因功能鉴定进程,而且使研究者对功能缺失表型进
行长期分析成为可能。amiRNAi避免了普通 RNAi的
脱靶以及非特异性反应等问题,再加上具有方便、快
捷、高通量筛查等优点,因此备受许多研究者青睐。作
为一种新型的基因沉默技术,它的应用必将加快功能
基因组与反向遗传学的研究进程。随着基因工程的日
益发展,各种遗传转化技术的改进,以及 amiRNA载体
的开发,将使amiRNAi的应用范围得到进一步拓展,如
为各种信号传导通路研究提供新的策略,研究amiRNAi
定点基因治疗,以及生物性状的基因负调控等。总之,
amiRNAi技术的诞生和不断完善,不仅是在普通 RNAi
基础上实现的又一重大突破,而且还将成为揭示生物
体基因表达调控本质的又一新的里程碑。
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2010,30(8) 叶梅霞 等:amiRNAi实现高效稳定的特异基因沉默新方法
amiRNAi:ANewApproachforHighlySpecificandStableGeneSilencing
YEMeixia LIUJunmei LIHao CUIDongqing WANGJingcheng ZHANGZhiyi ANXinmin
(NationalEngineeringLaboratoryforTreeBreeding;KeyLaboratoryofGeneticsandBreedinginForestTreesand
OrnamentalPlants,MinistryofEducation;TheTreeandOrnamentalPlantBreedingandBiotechnologyLaboratory
ofStateForestryAdministration,BeijingForestryUniversity,Beijing 100083,China)
Abstract RNAinterference(RNAi)isanefficienttoolforgenesilencing.Duetoenormousadvanceof
molecularbiologyandbiotechnologyachievedinrecentyears,ithasevolvedintoanotherexcellenttechnologyfor
genesilencingwith higherspecificitycalled artificialmicroRNA interference(amiRNAi). amiRNA,
approximately21nucleotideslong,whichcouldbegeneratedbyendogenousmiRNAprecursors,canmediatethe
silencingofsingleormultiplegenestargetedwithoutaffectingexpressionsofunrelatedgenes.Comparedwiththe
conventionalRNAi,thisnoveltechnologyhasadvantagesofhighspecificity,satisfactorystabilityaswellas
precisepredictabilityofsilencingeffect.ThustheamiRNAidefinitelyprovestobeoneofthemostpowerfultools
forthefunctionalanalysisofheterogeneousgenes.Alsoitpromisesabrightfutureforbothstudyandapplication
ofgenes’negativeregulation.TheveryprincipleofamiRNAiwasreviewedanditssuperiorityandpotential
applicationswerediscussed.
Keywords amiRNAi miRNA siRNA Genesilencing
慕尼黑上海分析生化展于北京召开新闻发布会
2010年8月5日,慕尼黑上海分析生化展项目组在北京召开了新闻发布会,即将召开的2010年慕尼黑上海分析生化展
最新情况。发布会由慕尼黑展览(上海)有限公司高级项目经理路王斌先生主持,慕尼黑展览(上海)有限公司董事总经理
毛大奔先生和安捷伦科技(中国)有限公司大中华区化学分析市场部经理何峻先生先后发言。毛大奔先生介绍了展会最新
情况:截止7月31日,已有来自19个国家和地区的450家企业报名参加2010年慕尼黑上海分析生化展,展会展览面积达
20000平方米,预计专业观众可达15000名。自从2002年第一届慕尼黑