【doc】武汉汉族4个Y-STR基因座遗传多态性调查

【doc】武汉汉族4个Y-STR基因座遗传多态性调查 武汉汉族4个Y-STR基因座遗传多态性调 查 皇堇生箜 武汉汉族4个Y.STR基因座遗传多态性调查 ? 技术交流? 杨荣芝,钱水,黄代新,陈慧,余纯应,杨庆恩(华中科技大学同济医学院法医学系,武汉430030) 摘要:目的调查汉族人群DYS19,GATA—A10,GATA-A7.2和DYS~58Y染色体STR基因座的遗传多态 性.方法4,1PCR和PAGE技术对160例无关男性血样进行4个Y—STR基因座分型.结果4个Y—STR 基因座群体调查分别发现5,5,6和9个等位基因,基因座GD值分别为0.6365,0.6996,0.6377和0.8239.共 检出107种单倍型,单倍型GD值为0.9867.结论4个Y—STR基因座均具有较高的遗传多态性,在法医学个 人识别和亲子鉴定有实用价值. 关键词:STR;Y染色体;遗传多态性 中图分类号:DF795.2文献标识码:A文章编号:1008—3650(2005)ol 一0027-04 Astudyofgeneticpolymorphismsof4Ychromosomespecifics陬 lociinWuhanHanpopulation YANGRong—zhi,QShui,HUANGDai—xin,atal(TongiMedicalCollegeo fHuazhongUniversityofScienceand一 nology,Wuhan430030,China) AB!RACr:ObjectiveTostudythegeneticpolymorphismsofDYS19,GATA-A10,GATA-A7.2andDYX458Ychrom~ome specificRTRlociinWuhanHanpopulation.MethodsTheDNAextractedfrombloodsamplesofunrelatedmeninHanpopulationliving inWuhanwereamplifiedbyPCR.ThePCRproductswereanalyzedusingPAGE.Results5,5,6and9alldesweredetectedinDYS19, GATA-A10,GATA-A7.2andDYs4584Y—SIRlocirespectivelyinHanpop ulation.Geneticdiversityvalueforthe4was0.6365, 0.6996,0.6377and0.8239respectively.Total107haplotypesmuldbeidentified,ThehaplotypeGDofthe4Y-SIRwas0.9867.Con- dusionThe4Y-specificSIRlociarehighlypolymorphicandaresuitableforindividualidentificationandpaternitytesting, KEY? lRDS:Shorttandemrepeat(SIR);Ychromosome;Geneticpolymorphism Y染色体短串联重复,序列是一类呈父系遗传的 多态性标记,在人类起源的研究,法医学个人识别,如 父系亲缘关系鉴定;男女混合成分的男性成分的检测 及多个男性混合成的同一性认定的鉴定等有重要的 应用价值[1--5].但与常染色体的STR相比较,Y染 色体上的STR数目较少,多态性相对较低.本文从 GDB中筛选4个Y染色体特异的STR基因座,调查 其在武汉地区汉族人群的遗传多态性,对其在法医学 中的应用价值进行初步探讨. 1材料与方法 1.1实验材料 武汉地区汉族160例无关男性个体枸橼酸钠抗 凝血,取自武汉同济医院血库和本室检验案例男性血 样. 1.2引物序列 DYS19,GATA—A10,GATA—A7.2和D84个 作者简介:杨荣芝(1962一)男,湖北潜江市人.主管技师,主 要从事法医物证检验工作.Td:(027)83692645 E-maihygen@mails.tjmu.edu.cn 基因座引物序列摘自数据库(GenomeDatabase, GDB)资料,由佳力生物有限公司合成,引物序列及其 相关资料见 表 关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf 1. 1.3DI提取和扩增 Chelex-100法提取基因组DNA.PCR扩增条件 参见参考文献[. 1.4PCR产物的分离与检测 4个Y—STR基因座的扩增产物用非变性PAG(T =6%C=5%)电泳分离,银染显示电泳结果.参照 等位基因梯阶对照,命名等位基因. 1.5等位基因梯阶的制备及结果判断 筛选不同基因分型的样本进行扩增,将扩增产物 混合作为等位基因分型梯阶对照标准(allelicladder). 每个基因座取2个等位基因进行测序,确定等位基因 中主型及其重复次数.按照重复次数命名等位基因. 1.6结果判断及数据处理 等位基因检出频率用直接计数法,遗传差异度值 按公式GD=1一?Pi2(Pi为等位基因频率)计算[. 2结果 武汉地区160例汉族DYS19,GATA—A10,GA一 ? 27? TA-A7.2和DYS458四个Y染色体基因座的多态性因(见图1--4),均具有较高的多态性. 调查显示(见表2,3),分别发现5,5,6和9个等位基 表1DYS19,GATA-A10,GATA-A7.2和DYS458基因座相关资料 表24个Y-STR基因座的等位基因频率和GD值(n=160) 表3武汉汉族男性DYS19,GATA-A10,GATA-A7.2和DYS458基因座单倍型频率(n=160) ? 28? 续表3 注:单倍型GD值=0.9867 Ll7l6l5l4l3LL2322212019L 图1DYS19等位基因分型图2GAIA—A10等位基因分型 L17I6I5I41312LL2120I9I8I7I6151413L 图3GAIA—A7.2等位基因分型图4DYS458等位基因分型 3讨论 人类Y染色体属近端着丝粒染色体,由长臂Yq 和微小的短臂Yp组成,DNA长度约60Mb.Y染色 体两端各有一小部分称拟常染色区(pseudoautosomal region),在减数分裂过程中,拟常染区可与X染色体 的相应区段进行交换,重组.其余大部分为Y一特异 性区,为非重组区,所有Y—STR基因座之间存在遗传 连锁的关系,基因频率均视作单倍型频率.Y—DNA 中STR基因座是重要的遗传标记.目前大约发现有 55个Y—STR. Y—STR有父系遗传特征,只能由父亲传递给儿 子.同一父系的成员中Y-STR基因型是一致的,这 在父系亲源关系鉴定有实用价值.本文案例是利用 父系亲缘关系成员的Y—STR具有共同单倍体型特 征,作为认定叔侄关系的旁证.通过Y—STR单倍型 分析 定性数据统计分析pdf销售业绩分析模板建筑结构震害分析销售进度分析表京东商城竞争战略分析 ,可进行父子,同胞兄弟,同父异母兄弟,叔侄,祖 孙等父系同代或隔代的亲缘关系鉴定. 由于Y一特异性区遗传标记之间存在遗传连锁的 关系,评估Y—STR基因座鉴别能力的指标采用遗传 差异度(geneticdiversity,GD).GD=1一?p2(P指 等位基因频率).GD值即该Y—STR基因座的个体识 别能力Dp值,数值也等于该座位的非父排除率 (PE).单个Y—STR基因座上,等位基因越多,GD值 ? 29? 越高.但是从单个座位看,遗传差异度有限,本文调 查160份男性血样的4个座位的GD值在0.6365, 0.8239范围,共检出107种单倍型,单倍型基因座多 样性为0.9867,具有较高的个体识别能力. 与常染色体STR类似,Y—STR等位基因片段长 度多在400bp以下,检测灵敏度高,扩增稳定,能够准 确分型,可重复性好.因此,Y—STR逐渐在法医鉴定 中普遍应用. 本文研究调查4个Y—STR个体识别率高,PAGE 谱带清楚,分型准确.为法医学个人识别及亲权鉴定 中常规STR检测提供了辅助检测手段,有较好的应 用价值. 4案例应用 2003年11月,安徽省某市法院委托本实验室做 一 亲子鉴定.被鉴定人可疑父亲陈某已去逝,陈某包 养的”二奶”范某所生的儿子陈某某要求继承陈某遗 产,家系情况见图5.对陈某某和陈某的弟弟进行Y— STR位点检测,本文研究的4个和另外6个Y—STR 的基因型均相同.结合我室32个常染色体STR位 点检测结果.认定陈某某与陈某弟弟是叔侄关系. 参考文献: [1]AnnabelGN,~/rlkeE’MaVLeta1.S唧ceStl’UCtH~0f 图5陈某家系图 12novelYchrol~osomemicrosatellitesandPCRarnplifica— tionstrategiJ].ForensicSciInt,2001,122:19. [2]MarffiedK,AnttiS.MutationatY—STRloci:implica— tionforpaternitytestingandforensicanalysis[J].Forensic SciInt,2001,l18:l16. [3]CarracedoA,Be&mannA,BengsA,eta1.乜0fa collalx~tivestudyofEDNAP哪re静rdingtherepro- ducibilityandrobusmessoftheY—chrann(嗍9. DYS389andDYS389.DYS390andDYS393inaPCRpenta— plext(maaat[J].F~msicSciInt,2001,l19:28. [4]CookeH.RepeatedsequencespecifictOhumanmat~[J]. Nature,1976,262:182. [5】RoewerL,ml’nelTlannJ,Spu~rNK,eta1.Aviewofrncd— emhumanoriginsformYChronlosomemicrosateUitevaria— tion[J].GenomeRes,1999,9:558 [6]杨庆恩,余纯应,陈慧,等.同步分型16个STR位点及法 医学应用研究[J].刑事技术,1999,(2):16. 收稿日期:2004—10—21 ? 案例分析? 陈梅梅(江苏省张家港市公安局刑警大队,215600) 关键词:眼部钝挫伤;眶内壁骨折;眼部cr;法医学检验 中图分类号:DF795.4文献标识码:C 文章编号:1008—3650(2005)01—0030—01 1案例简介 在基层法医I临床检验中,被他人用拳击伤眼部的事件较 为多见.眼部损伤多简单地表现为眶周青紫,肿胀等眼钝挫 伤表现,短时间内能恢复正常,办案人员多不引起重视.但 是,笔者作为一名基层法医工作者,却认为眼部钝挫伤应详细 检验.在2002年11月至2003年10月的法医工作中,笔者接 到的涉及眼部钝挫伤的检案共有20例,其中伤者配合检验, 遵嘱做眼部cr检查,确证眼眶内侧壁骨折的案例有10例. 在此20例检案中,全部伤者均有视物不清,眼睑青紫肿 胀等眼钝挫伤的临床症状和体征,均角膜明,前房清,眼底未 检见异常,临床诊断为眼钝挫伤.经法医建议,作cr检查的 ? 30? 检案13例,确证眼眶内侧壁骨折的10例,阳性率占眼部钝挫 伤的50%.其中:合并鼻腔出血者三例,合并筛窦积液者三例, 合并内直肌受累及复视者五例.另有7例检案伤者不合作, 眶壁骨折情况不祥. 2讨论 眼眶位于颅面中央垂直线两侧,由额骨,颧骨,上颌骨,泪 骨,筛骨,蝶骨和腭骨七块骨构成.其中眶内侧壁呈长方形, 与正中面平行,由4块骨构成.额骨角突与泪骨构成前部及 泪囊窝,中部占内壁最大部分的是筛骨纸板,厚0.2,0.4mm, 后部小块为蝶骨.由于眼眶位于颅面中央向前突起,容易遭 受外力打击,如常见的拳头正面打击眼部,可使眶内压力突然 升高,外力借液压传导至眶壁,致眶部最薄弱的骨性结构即眶 内侧壁中部发生骨折.眶内侧前面与泪囊和鼻腔为邻,中间 大部分与筛窦相接,眶内侧壁最易发生与筛窦和鼻腔相通的 骨折,在临床上表现为眶外伤后鼻出血及筛窦积液.在法医 临床检验中,眼部受到外力打击所致的外伤各不相同,其临床 表现和体征有很大的差异.部分病例外伤后仅表现为眼睑水 肿,眶周血肿和瘀斑,颜面部肿胀等软组织钝挫伤的临床表 现,由筛骨和上颌骨骨折导致的眶外伤后鼻出(下转第60页)