近交系数的计算
近交系数的计算-答案
设有下列系谱，试用一般计算公式、共亲系数列
表
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算法以及加性遗传相关算法分别求
各个体的近交系数和个体间的亲缘系数。
A C E
F H X B D G
答:
一、近交系数的计算
(一)利用近交系数的一般公式计算
1. X个体
(1)父母A和B的共同祖先有:C、D、F、H;它们均为非近交个体(判断一个个体是否为近交个体的依
据是看其父母是否有共同祖先，如果双亲只知道一方或均未知则默认其为非近交个体)，因此，F =0，F CD
=0，F =0，F =0。 FH
(2)找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出F X
通径链 共同祖先的近交系数 通径链的系数 n1+n2+1
31 3 A?C?B F =0 ()C2
313 A?D?B F() =0 D2
51()5 A?C?F?D?B F =0 F2
51()5 A?D?F?C?B F =0 F2
71()7 A?C?E?H?G?D?B F =0 H2
71()7 A?D?G?H?E?C?B F =0 H2
F = 21/64 X
2. A个体
(1)父母C和D的共同祖先有F和H，且F =0，F =0。 FH
(2)找通径链，并计算各通径链的系数，求和计算出F。 A
通径链 共同祖先的近交系数 通径链的系数 n1+n2+1
31 3 C?F?D F =0 ()F2
51()5 A?E?F?G?D F =0 H2
F = 5/32 A
3.B个体，与A个体同父同母，因此与A相同。F = 5/32。 B
4.其余个体C、D、E、F、G、H均为非近交个体，F =0，F =0，F =0，F =0，F =0，F =0。 CDEFGH(二)利用加性遗传相关列表算法
1. 将系谱中的个体按照世代从高到低分别从左到右、从上到下排列，并将个体的双亲编号列于个体的上方。
2. 利用公式
11F,aa = a = (a+a)a,1，Fxxxxyyxxyxyxxxsdsd 22
计算两两个体间的加性遗传相关，并列表。其中，x、y分别表示任意一个个体;x、x分别表示x个体的sd父亲和母亲;y、y分别表示y个体的父亲和母亲。 sd
个体间加性遗传相关
H H EF EF CD CD AB
H E G F C D A B X H 1 1/2 1/2 0 1/4 1/4 1/4 1/4 1/4 E 1 1/4 0 1/2 1/8 5/16 5/16 5/16 G 1 0 1/8 1/2 5/16 5/16 5/16 F 1 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 C 1 5/16 21/32 21/32 21/32 D 1 21/32 21/32 21/32 A 37/32 21/32 29/32 B 37/32 29/32
X 85/64
3.利用公式
F,a,1XXX
计算每个个体的近交系数:F = 1 - 1 = 0, F = 1 - 1 = 0，F = 1 - 1 = 0=0，F = 1 - 1 = 0，F = 1 - 1 = 0，HEGFCF = 1 - 1 = 0，F = 37/32- 1 = 5/32，F = 37/32- 1 = 5/32，F= 85/64- 1 = 21/64。 DABX
二、亲缘系数的计算
根据个体间加性遗传相关列表中的数据，利用公式
aXYr, XYaaXXYY
计算两两个体间的亲缘系数。
个体间亲缘系数
H E G F C D A B X H 1/2 1/2 0 1/4 1/4 2/ 22853737E 1/4 0 1/2 1/8 2.5/ 2.5 2.5/ 857474G 0 1/8 1/2 2.5/ 2.5 2.5/ 857474F 1/2 1/2 2/ 2/ 4/ 857474C 5/16 5.25/ 5.25/ 5.25/ 857474D 5.25/ 5.25/ 5.25/ 857474A 21/37 58/ 8574B 58/ 8574
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