解螺旋文献精读第十六讲课件

文献精读·春季班2017解螺旋课堂酸菜文献精读·春季班课程 表 关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf 2月19日2月26日3月5日3月12日3月19日3月26日骨科干细胞靶向耐药神经肿瘤代谢TCGA数据库4月9日4月16日4月23日5月7日5月14日5月21日肿瘤转移lncRNA心医学统计内生信/R语言日6月11日6月18日7月2日系统生物学肿瘤免疫消化炎症免疫/肿瘤转移文献精读·春季班第十六讲免疫炎症与自噬文献精读·春季班1背景知识参考文献：PMID:28529316GalluzziL.Pharmacologicalmodulationofautophagy:therapeuticpotentialandpersistingobstacles[J].NatureReviewsDrugDiscovery,2017.文献精读·春季班1背景知识参考文献：PMID:23890059ChenDetal.OncologyMeetsImmunology:TheCancer-ImmunityCycle[J].Immunity,2013,39(1):1PMCID:PMC3824109RussBE,etal.Tcellimmunityasatoolforstudyingepigeneticregulationofcellulardifferentiation.[J].FrontiersinGenetics,2013,4(4):218..文献精读·春季班1背景知识HeatshockresponseInfections2112AutoimmuneOxidativeStress“型”到“疾”disorders驱动因素ImmuneresponsesandUnfoldedproteinInflammationChronicresponseInflammatory3344conditionsCancerDNAdemageresponse文献精读·春季班2结果概览摘要：6-8句•交代背景•提出12•阐释结果3•总结意义文献精读·春季班2结果概览细胞功能机制Fig.2敲除Atg16l1可Fig.3敲除Atg16l1显示出更Fig.4Atg16l1对肠粘膜Fig.5Atg16l1小鼠移植调节Treg和Th2亚群强的外源抗原体液免疫反应Treg的存活有显著影响pTreg无法逆转Th2变化功ΔFoxp3现象Fig.8Atg16l1老鼠能的糖、脂代谢显著改变Fig.1小鼠T细胞选择性敲除Atg16l1导致自发性肠道炎症分子Fig.6在Treg中敲除Atg16l1Fig.7Atg16l1ΔFoxp3老鼠机制与Atg16l1ΔCD4的表型一致存在自发性的炎症反应文献精读·春季班3数据解构Atg16l1ΔCD4=应用Cre-Loxp系统在T细胞中选择性敲除Atg16l1的转小鼠图A：Atg16l1ΔCD4小鼠CD4+T细胞自噬体形成受到阻碍（流式检测）Fig.1T细胞选择性敲除Atg16l1导致动物自发性肠道炎症疾病图B：Atg16l1ΔCD4小鼠CD4+T细胞LC3II积累减少（WesternBlot）文献精读·春季班3数据解构图C：Atg16l1ΔCD4小鼠体重增长曲线，显示五月龄后体重进入平台期Fig.1T细胞选择性敲除Atg16l1导致动物自发性肠道炎症疾病文献精读·春季班3数据解构图D,E：Atg16l1ΔCD4小鼠表现为脾脏和淋巴肿大Fig.1T细胞选择性敲除Atg16l1导致动物自发性肠道炎症疾病文献精读·春季班3数据解构Fig.1T细胞选择性敲除Atg16l1图F-I：Atg16l1ΔCD4小鼠随发展为肠道慢性炎症病理特征导致动物自发性肠道炎症疾病（a.小肠长度增加；b.隐窝深度增加；c.肠绒毛变短；d.肠上皮细胞增生）文献精读·春季班3数据解构Spleen：脾脏mLN：肠系膜淋巴结cLP：结肠固有层淋巴细胞SILP：小肠固有层淋巴细胞图A：Atg16l1ΔCD4小鼠中CD4+T细胞显著减少图B，C：Atg16l1ΔCD4小鼠中辅助性T细胞亚群变化情况Fig.2敲除Atg16l1对肠道的（IFN-g+Th1,IL-17A+Th17andIL-13+Th2）Treg和Th2细胞有调节作用文献精读·春季班3数据解构图D：Atg16l1ΔCD4小鼠中辅助性T细胞亚群变化情况Fig.2敲除Atg16l1对肠道的（转录因子Gata3是Th2特异性marker）Treg和Th2细胞有调节作用文献精读·春季班3数据解构Spleen：脾脏mLN：肠系膜淋巴结cLP：结肠固有层淋巴细胞SILP：小肠固有层淋巴细胞图E：Atg16l1ΔCD4小鼠中Gata3+Th2细胞显著增加Fig.2敲除Atg16l1对肠道的Treg和Th2细胞有调节作用文献精读·春季班3数据解构图F，G：Atg16l1ΔCD4小鼠中Foxp3+Treg细胞显著减少（转录因子Foxp3是调节性T细胞特异性marker）Fig.2敲除Atg16l1对肠道的Treg和Th2细胞有调节作用文献精读·春季班3数据解构图A：Atg16l1ΔCD4小鼠血清免疫球蛋白IgE表达显著上调（ELISA）Fig.3敲除Atg16l1小鼠显示出图B：Atg16l1ΔCD4小鼠血清免疫球蛋白IgG各亚型、IgA、IgM变化情况（ELISA）更强的外源抗原体液免疫反应图C：小肠派结（Peyre’sPatch）HE染色图片文献精读·春季班3数据解构FoodCommensal-derived图D：Atg16l1ΔCD4小鼠抗软磷脂抗体含量显著升高，正常组检测不到（ELISA）图E：Atg16l1ΔCD4小鼠喂食鸡卵清白蛋白或加霍乱毒素处置后IgE显著增高（ELISA）图F：Atg16l1ΔCD4小鼠用来源于菌群的鞭毛蛋白抗原刺激，IgG1和IgA显著增高（ELISA）Fig.3敲除Atg16l1小鼠显示出更强的外源抗原体液免疫反应文献精读·春季班3数据解构48hr图A-C：从Atg16l1ΔCD4和对照小鼠中分离naïveCD4+T细胞进行诱导分化，无显著差异（说明敲除Atg16l1对Th2和Treg的影响不是通过分化）Fig.4敲除Atg16l1对小鼠肠固有层Treg细胞存活有显著影响文献精读·春季班3数据解构48hr5daysIL-4+IL-13图D：用IL-4，IL-13刺激Atg16l1ΔCD4和对照小鼠中分离Foxp3+Treg细胞，无显著差异（考虑Th2细胞的以负调节Treg，进行排除）Fig.4敲除Atg16l1对小鼠肠固有层Treg细胞存活有显著影响文献精读·春季班3数据解构48hr5dayspolarizing(E)1mg/mlor(F)5mg/mlanti-CD3plusanti-CD28(1mg/ml)图E，F：Atg16l1ΔCD4和对照小鼠中分离naïveCD4+T细胞进行长期诱导，Th2明显升高，Treg显著减少Fig.4敲除Atg16l1对小鼠肠固有层Treg细胞存活有显著影响文献精读·春季班3数据解构图G：Atg16l1ΔCD4和对照小鼠中分离结肠固有层CD4+T细胞进行凋亡检测，Treg凋亡率显著增加，Th2影响不显著Together,theseresultsindicatethatAtg16l1-deficiencydoesnotimpairthedifferentiationFig.4Atg16l1对小鼠肠固有层orstabilityofTregcellsanddoesnotpromotedifferentiationtowardstheTH2lineage.Treg细胞存活有显著影响However,autophagydifferentiallyimpactsonthesurvivalofmucosalTregandTH2cells.文献精读·春季班3数据解构C57BL/6（CD45.2）、SJL（CD45.1）YoungAtg16l1ΔCD4mice(CD45.2+)wereadoptivelytransferredwith4-5x106naïveWTCD4+Tcells(CD45.1+)andanalyzed3monthslater.图A：Atg16l1ΔCD4过继性输入pTreg细胞后脾脏，肠系膜淋巴结和结肠固有层淋巴细胞的CD4+T细胞中CD45.1+与CD45.2+细胞比例分布，cLP中CD45.1+有生存优势（pTreg——外周调节性T细胞，主要位于肠道粘膜，可抑制Th2细胞免疫反应）图B：Atg16l1ΔCD4过继性输入pTreg细胞脾脏，肠系膜淋巴结和结肠固有层淋巴细胞的Foxp3+Treg细胞中CD45.1+与CD45.2+细胞比例分布Fig.5Atg16l1小鼠移植野生型pTreg细胞无法逆转Th2变化结论：在Atg16l1ΔCD4回复Treg细胞文献精读·春季班3数据解构代表性结果统计学结果图C-E：Atg16l1ΔCD4过继性输入pTreg细胞后结肠固有层淋巴细胞中Th2、Th1和Th17Fig.5Atg16l1小鼠移植野生型细胞比例，CD45.2的Th2比例较高，Th1比例较低，源于cLP中Th2的激活pTreg细胞无法逆转Th2变化文献精读·春季班3数据解构图F-H：Atg16l1ΔCD4过继性输入WTpTreg细胞不能逆转肠道炎理反应，IgE依然显著增高，推测Th2细胞上升并非受到Treg影响，是内源性作用Fig.5Atg16l1小鼠移植野生型pTreg细胞无法逆转Th2变化文献精读·春季班3数据解构图A，B：在野生型老鼠中，Foxp3+Treg细胞的自噬水平显著高于Foxp3-CD4+T细胞（提示Treg对自噬有依赖）Fig.6在Treg中敲除Atg16l1与Atg16l1ΔCD4的表型一致文献精读·春季班3数据解构Atg16l1ΔFoxp3=在Foxp3+Treg细胞中选择性敲除Atg16l1的转小鼠Fig.6在Treg中敲除Atg16l1ΔCD4与Atg16l1的表型一致图C-E：五后发生严重炎症性疾病症状，体重减轻，脾脏和淋巴肿大，小肠长度增加，以及多组织的白细胞侵润文献精读·春季班3数据解构图A：小肠和结肠的CD3染色荧光图片CD3(red),b-catenin(green)andDAPI(blue)图B，C：结肠固有层淋巴细胞中CD4+TCRβ+T细胞比例和数量Fig.7Atg16l1ΔFoxp3老鼠自发性的炎症反应文献精读·春季班3数据解构图D：肠系膜淋巴结和结肠固有层淋巴细胞中效应性T细胞的比例Fig.7Atg16l1ΔFoxp3老鼠图E，F：结肠固有层淋巴细胞中Th1、Th2、Th17细胞比例和数量自发性的炎症反应图G：脾脏、肠系膜淋巴结和结肠固有层淋巴细胞中Gata3CD4+T细胞比例图H：血清中免疫球蛋白IgE含量文献精读·春季班3数据解构图A，B：Atg16l1ΔFoxp3老鼠脾脏、肠系膜淋巴结和结肠固有层淋巴细胞中Treg细胞在CD4+TCRβ+T细胞所占比例显著减少，而胸腺无差异Fig.8Atg16l1ΔFoxp3老鼠的糖脂代谢水平显著改变文献精读·春季班3数据解构图C：年轻的Atg16l1ΔFoxp3老鼠脾脏和结肠固有层淋巴细胞的Treg中 分析 定性数据统计分析pdf销售业绩分析模板建筑结构震害分析销售进度分析表京东商城竞争战略分析 糖代谢相关表达Fig.8Atg16l1ΔFoxp3老鼠的糖脂代谢水平显著改变文献精读·春季班3数据解构FAS:fattyacidsynthesis,FAO:fattyacidoxidation图D：年轻的Atg16l1ΔFoxp3老鼠脾脏和结肠固有层淋巴细胞的Treg中分析脂代谢相关表达Fig.8Atg16l1ΔFoxp3老鼠的糖脂代谢水平显著改变文献精读·春季班4套路12345恒疾病表型模型检测标记DiseasePhenotypeMAssayBiomarkerIBD自噬Atg16l1ΔFoxp3KO老鼠流式细胞检测Th2细胞表面标记炎症Atg16l1ΔCD4KO老鼠组织学检测Treg细胞表面标记Treg/Th2qPCR…糖，脂代谢标志Atg16l1变文献精读·春季班4套路表型表型文献精读·春季班4套路套路深化：加机制12345恒疾病表型模型检测标记DiseasePhenotypeMAssayBiomarkerIBD自噬XΔFoxp3KO老鼠流式细胞检测Th1，2，17细胞表面标记炎症XΔCD4KO老鼠组织学检测Treg细胞表面标记Treg/Th2/Th1/Th17……qPCR…XY(已知)Pathway变文献精读·春季班4套路套路简化：Fig1-512345恒疾病表型模型检测标记DiseasePhenotypeMAssayBiomarkerIBD炎症XΔCD4KO老鼠流式细胞检测Th2细胞表面标记Treg/Th2组织学检测Treg细胞表面标记qPCR…X变文献精读·春季班4套路套路简化：Fig6-812345恒疾病表型模型检测标记DiseasePhenotypeMAssayBiomarkerIBD炎症XΔFoxp3KO老鼠流式细胞检测Treg细胞表面标记Treg组织学检测qPCR…X变文献精读·春季班5每周听课每周一点科研进步，成就更好的！服务号三十六策谈·最前沿公开课酸谈号：HelixLife-1医学基础科研知识体系学术前沿的创新思维开放式，干货对医学科研的思考酸老菜谈文献精读·春季班THEEND解螺旋不生产科研套路，我们只是套路的搬运工扫描二维码添加“文献菌”为好友即日起至8月31日，春季班学员立刻获得【文献精读秋季班】19.9元权益（原价99元）