玻璃板处理
6%的聚丙烯酰胺凝胶属于DNA测序胶,胶厚度仅为0.4mm,从玻璃板上玻璃后难以进行后续的显色操作,因此,必须对玻璃板进行硅烷化处理。在对玻璃板硅烷化处理之前,必须采用温水和洗涤剂将玻璃板彻底洗干净,先以自来水冲去洗涤剂,再用去离子水反复冲洗几遍,晾干或烘干。
长玻璃板的处理:
A. 带PE手套,将洗好的长玻璃板采用95%擦洗2~3次,晾干。用镜头纸蘸取亲和硅烷溶液少许(A4纸大小的玻璃板用150-200 μl),涂布在长玻璃板的一侧,整块板涂布均匀,不能有死角。
B. 4~5 min后,用95%的乙醇洗长玻璃板3次,以去除多余的亲和硅烷,待用。
短玻璃板(上部带有凹槽)处理:
A. 更换PE手套,将洗好的短玻璃板采用95%擦洗2~3次,晾干。用镜头纸蘸取剥离硅烷溶液适量(A4纸大小的玻璃板用1-1.5 ml),涂布在短玻璃板的一侧,整块板涂布均匀,不能有死角。
B. 5~10 min后,用干净镜头纸擦去多余的剥离硅烷,待用。
注意事项:在玻璃板的处理过程中,处理好的玻璃板一侧应该做好标记,保持干净。长短玻璃板分开处理,及时更换PE手套避免交叉污染。最后,玻璃板的硅烷化处理应该在通风橱中进行。
凝胶制备
在制胶台上固定好玻璃板,保持水平。制备6%的变性聚丙烯酰胺凝胶,一块胶的配方如下:
5 × TBE
16 ml
尿素(分析纯)
33.6 g
40%的丙烯酰胺
12 ml
ddH2O
补足至80 ml
0.25 μm 滤膜过滤,灌胶前加入10%过硫酸铵(APS)800μl,四甲基乙二胺(TEMED)100μl,充分混匀,水平灌胶。灌胶完成后倒插梳子(鲨鱼齿朝外)封口,水平放置过夜。
银染
A. 电泳完毕,卸板,用超纯水冲洗板外侧后小心地分开两板,凝胶应该牢固地附着在长玻璃板上,避免划破胶面。
B. 固定:将凝胶(连玻璃板)放入塑料盘,用固定溶液(7.5%冰乙酸)浸没,充分振荡至样品中染料完全消失。保留固定溶液,用于终止显影反应。
C. 洗胶:用超纯水振荡洗胶3次,每次5分钟。从水中取出,当转移至下一溶液时拿着胶板边沿静止30s,使水流尽,再进行下一次洗涤。
D. 染色:凝胶移至0.1%AgNO3(使用前按1.5ml/l加入37%新鲜甲醛)充分摇动30分钟。
E. 取出凝胶放入装有超纯水的盘中浸洗5-10 s,迅速转移至显影液。
F. 显影:在已冷却至4℃的3%碳酸钠溶液中(当天配制,预冷),按1.5ml/l加入37%新鲜甲醛和200μl/l的硫代硫酸钠溶液(10mg/ml)。先倒入一半显影液,第一批条带出现后再加入另一板显影液,轻摇至条带全部出现。
G. 终止:条带全部出现后,倒入固定液终止显影。
H. 当不在有气泡逸出,换超纯水洗涤2次,每次3 min。
I. 干胶:将凝胶置于室温干燥。干燥后在可见光灯箱上观察凝胶,数码相机拍照记录。
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